More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1917 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  49.09 
 
 		 1145 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  48.56 
 
 		 1179 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  49.65 
 
 		 1170 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  47.3 
 
 		 1155 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  48.85 
 
 		 1228 aa  736    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  48.2 
 
 		 1149 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3682  DNA polymerase III subunit alpha  46.02 
 
 		 874 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.362078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  45.75 
 
 		 1240 aa  672    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  47.07 
 
 		 1454 aa  688    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  49.72 
 
 		 1132 aa  703    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  46.31 
 
 		 1156 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  48.73 
 
 		 1180 aa  672    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  52.66 
 
 		 1139 aa  739    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  47.63 
 
 		 1178 aa  640    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  46.02 
 
 		 1167 aa  671    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  46.29 
 
 		 1165 aa  657    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  48.46 
 
 		 1161 aa  666    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  46.42 
 
 		 1148 aa  672    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  49.65 
 
 		 1181 aa  725    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  50.07 
 
 		 1170 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  46.8 
 
 		 1155 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1603  DNA polymerase III subunit alpha  42.18 
 
 		 877 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  49.22 
 
 		 1170 aa  674    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  52.57 
 
 		 1214 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  48.13 
 
 		 1156 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  52.77 
 
 		 1127 aa  781    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  49.03 
 
 		 1151 aa  674    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  46.89 
 
 		 1172 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  51.47 
 
 		 1145 aa  730    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  47.86 
 
 		 1172 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  46.73 
 
 		 1155 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  48.61 
 
 		 1165 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  46.21 
 
 		 1257 aa  668    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2199  DNA polymerase III subunit alpha  42.7 
 
 		 870 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.16253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  45.48 
 
 		 1186 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  52.51 
 
 		 1156 aa  748    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3404  DNA polymerase III subunit alpha  45.7 
 
 		 876 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.605103 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  45.58 
 
 		 1189 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  46.42 
 
 		 1476 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2092  DNA polymerase III, alpha subunit  48.26 
 
 		 1271 aa  689    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346877  normal  0.0514777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2428  DNA polymerase III subunit alpha  46.02 
 
 		 874 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  49.1 
 
 		 1159 aa  687    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  48.54 
 
 		 1173 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  60.82 
 
 		 1148 aa  902    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  51.57 
 
 		 1205 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  50.28 
 
 		 1225 aa  717    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1607 aa  3298    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  45.03 
 
 		 1182 aa  637    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  46.05 
 
 		 1159 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  48.2 
 
 		 1171 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  47.4 
 
 		 1160 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  50.14 
 
 		 1190 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  46.77 
 
 		 1165 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  53.59 
 
 		 1194 aa  796    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  49.01 
 
 		 1134 aa  717    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  47.05 
 
 		 1262 aa  675    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  44.87 
 
 		 1510 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  52.03 
 
 		 1075 aa  742    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  49.01 
 
 		 1130 aa  680    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  47.54 
 
 		 1174 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  50.92 
 
 		 1139 aa  745    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  48.02 
 
 		 1164 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  47.3 
 
 		 1157 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  48.02 
 
 		 1122 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  48.5 
 
 		 1184 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  44.91 
 
 		 1485 aa  683    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  46.51 
 
 		 1159 aa  679    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0427  DNA polymerase III, alpha subunit  51.76 
 
 		 1216 aa  762    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  49.93 
 
 		 1175 aa  704    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  47.66 
 
 		 1162 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  48.44 
 
 		 1190 aa  636  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  45.32 
 
 		 1210 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  45.45 
 
 		 1210 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  46.47 
 
 		 1171 aa  632  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  44.25 
 
 		 1200 aa  628  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  45.32 
 
 		 1210 aa  629  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  43.59 
 
 		 1203 aa  629  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  44.92 
 
 		 1217 aa  629  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  37.25 
 
 		 2684 aa  627  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  43.84 
 
 		 1200 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0892  DNA polymerase III subunit alpha  43.71 
 
 		 1197 aa  627  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0260823  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  44.82 
 
 		 1237 aa  625  1e-177  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  43.41 
 
 		 1201 aa  625  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  44.11 
 
 		 1200 aa  625  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  45.15 
 
 		 1172 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  45.29 
 
 		 1172 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  46.52 
 
 		 1182 aa  622  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  45.78 
 
 		 1165 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  43.47 
 
 		 1186 aa  619  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  44.67 
 
 		 1165 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  45.15 
 
 		 1165 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  43.88 
 
 		 1213 aa  615  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  44.95 
 
 		 1165 aa  612  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4135  DNA polymerase III subunit alpha  44.8 
 
 		 877 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.14344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  44.37 
 
 		 1296 aa  610  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  44.79 
 
 		 1175 aa  608  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  45.22 
 
 		 1180 aa  608  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  44.82 
 
 		 1176 aa  605  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  44.7 
 
 		 1177 aa  602  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  43.73 
 
 		 1279 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>