More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1603 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  42.69 
 
 		 1173 aa  665    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  45.52 
 
 		 1170 aa  654    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  44.99 
 
 		 1155 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  43.58 
 
 		 1156 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  43.62 
 
 		 1139 aa  655    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  45.36 
 
 		 1075 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  45.16 
 
 		 1145 aa  710    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4135  DNA polymerase III subunit alpha  87.1 
 
 		 877 aa  1608    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.14344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  45.98 
 
 		 1139 aa  701    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  45.79 
 
 		 1225 aa  709    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3404  DNA polymerase III subunit alpha  76.75 
 
 		 876 aa  1419    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.605103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  67.38 
 
 		 1172 aa  1123    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  63.72 
 
 		 1165 aa  1059    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  44.82 
 
 		 1181 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  44.88 
 
 		 1170 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1603  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 877 aa  1809    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  44.03 
 
 		 1159 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  46.21 
 
 		 1127 aa  732    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  44.95 
 
 		 1156 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  68.27 
 
 		 1172 aa  1137    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  68.39 
 
 		 1172 aa  1140    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  45.43 
 
 		 1155 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  44.21 
 
 		 1165 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  43.65 
 
 		 1151 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  42.65 
 
 		 1186 aa  654    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  63.21 
 
 		 1165 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2199  DNA polymerase III subunit alpha  72.74 
 
 		 870 aa  1337    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.16253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  45.14 
 
 		 1170 aa  654    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  43.64 
 
 		 1155 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  46.66 
 
 		 1156 aa  716    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  45.57 
 
 		 1134 aa  690    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  43.61 
 
 		 1179 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  60.64 
 
 		 1165 aa  1051    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  44.22 
 
 		 1174 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  63.34 
 
 		 1165 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  46.34 
 
 		 1145 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  42.93 
 
 		 1159 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  67.38 
 
 		 1171 aa  1120    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.77 
 
 		 1122 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  44.53 
 
 		 1165 aa  665    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  72.12 
 
 		 2684 aa  1117    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  43.52 
 
 		 1130 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  42.18 
 
 		 1607 aa  636    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3682  DNA polymerase III subunit alpha  76.09 
 
 		 874 aa  1414    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.362078 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  66.62 
 
 		 1171 aa  1095    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  43.41 
 
 		 1164 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  43.18 
 
 		 1132 aa  669    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  44.68 
 
 		 1184 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  75.85 
 
 		 1162 aa  1269    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  44.67 
 
 		 1157 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  67.51 
 
 		 1172 aa  1123    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  44.33 
 
 		 1175 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2428  DNA polymerase III subunit alpha  76.09 
 
 		 874 aa  1414    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  42.96 
 
 		 1190 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  42.54 
 
 		 1160 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  42.27 
 
 		 1167 aa  631  1e-179  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  45.03 
 
 		 1161 aa  627  1e-178  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  42.01 
 
 		 1182 aa  622  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.71 
 
 		 1165 aa  624  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  41.81 
 
 		 1148 aa  622  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  41.81 
 
 		 1194 aa  620  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  43.35 
 
 		 1148 aa  622  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  42.15 
 
 		 1200 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  41.83 
 
 		 1186 aa  615  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  42.03 
 
 		 1200 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  41.59 
 
 		 1159 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  42.42 
 
 		 1149 aa  610  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  41.83 
 
 		 1201 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  41.9 
 
 		 1200 aa  611  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0892  DNA polymerase III subunit alpha  41.53 
 
 		 1197 aa  610  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0260823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  41.09 
 
 		 1210 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  40.97 
 
 		 1210 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  41.58 
 
 		 1203 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  41.09 
 
 		 1217 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2092  DNA polymerase III, alpha subunit  40.69 
 
 		 1271 aa  603  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346877  normal  0.0514777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  40.97 
 
 		 1210 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  40.58 
 
 		 1201 aa  604  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  40.79 
 
 		 1162 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  42.44 
 
 		 1180 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38840  DNA polymerase III subunit alpha  40.86 
 
 		 1176 aa  596  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  40.27 
 
 		 1189 aa  595  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  40.62 
 
 		 1279 aa  597  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  40.98 
 
 		 1190 aa  598  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  39.9 
 
 		 1240 aa  594  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  40.5 
 
 		 1272 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  40.94 
 
 		 1182 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  40.59 
 
 		 1213 aa  595  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  40.12 
 
 		 1195 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  42.05 
 
 		 1174 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  40.07 
 
 		 1257 aa  590  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  40.41 
 
 		 1214 aa  592  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  40.29 
 
 		 1177 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  41.69 
 
 		 1166 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  39.71 
 
 		 1168 aa  591  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  39.46 
 
 		 1182 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  41.69 
 
 		 1167 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  40.32 
 
 		 1296 aa  588  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  40.39 
 
 		 1262 aa  588  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  41.12 
 
 		 1260 aa  585  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  39.95 
 
 		 1205 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>