More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3682 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  43.89 
 
 
1179 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  45.7 
 
 
1173 aa  678    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  45.05 
 
 
1155 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  45.97 
 
 
1134 aa  704    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  44.74 
 
 
1157 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  43.91 
 
 
1155 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  45.11 
 
 
1174 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  43.91 
 
 
1186 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  65.7 
 
 
1171 aa  1084    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  65.57 
 
 
1172 aa  1082    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  63.68 
 
 
1165 aa  1058    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1603  DNA polymerase III subunit alpha  76.09 
 
 
877 aa  1414    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4135  DNA polymerase III subunit alpha  76.38 
 
 
877 aa  1403    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.14344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  45.73 
 
 
1181 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  43.36 
 
 
1156 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  43.3 
 
 
1167 aa  638    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  65.2 
 
 
1172 aa  1090    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  66.58 
 
 
1172 aa  1112    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  45.13 
 
 
1155 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  44.53 
 
 
1165 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  77.25 
 
 
1162 aa  1254    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  43.32 
 
 
1122 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  63.81 
 
 
1165 aa  1058    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2199  DNA polymerase III subunit alpha  70.94 
 
 
870 aa  1302    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.16253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  46.36 
 
 
1145 aa  711    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  46.83 
 
 
1156 aa  728    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  46.62 
 
 
1161 aa  647    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  43.15 
 
 
1151 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  64.44 
 
 
1165 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  44.03 
 
 
1139 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  46.81 
 
 
1127 aa  729    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  44.9 
 
 
1132 aa  682    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  65.45 
 
 
1172 aa  1080    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  67.34 
 
 
1171 aa  1107    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  43.18 
 
 
1159 aa  667    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  43.54 
 
 
1159 aa  651    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3682  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 
874 aa  1801    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.362078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  43.66 
 
 
1165 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  45.8 
 
 
1225 aa  714    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  75.42 
 
 
2684 aa  1150    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  63.81 
 
 
1165 aa  1058    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3404  DNA polymerase III subunit alpha  84.34 
 
 
876 aa  1534    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.605103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  46.2 
 
 
1130 aa  714    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  43.8 
 
 
1165 aa  658    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  48.46 
 
 
1139 aa  724    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  43.59 
 
 
1164 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  46.02 
 
 
1607 aa  648    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  46.73 
 
 
1145 aa  708    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  44.36 
 
 
1184 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2428  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 
874 aa  1801    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  44.6 
 
 
1175 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  47.18 
 
 
1075 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  43.85 
 
 
1156 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  42.41 
 
 
1160 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  43.03 
 
 
1159 aa  633  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  44.19 
 
 
1170 aa  630  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.06 
 
 
1170 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  42.77 
 
 
1148 aa  630  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  43.96 
 
 
1190 aa  628  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  43.9 
 
 
1149 aa  622  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  43.55 
 
 
1170 aa  622  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  41.81 
 
 
1189 aa  616  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  40.76 
 
 
1210 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  43.59 
 
 
1180 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  40.57 
 
 
1240 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  42.84 
 
 
1182 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  42.12 
 
 
1182 aa  615  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  39.98 
 
 
1194 aa  614  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  40.76 
 
 
1210 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  40.64 
 
 
1217 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  41.66 
 
 
1257 aa  612  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  40.76 
 
 
1210 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  42.33 
 
 
1148 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  41.69 
 
 
1296 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  41.9 
 
 
1200 aa  605  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  41.78 
 
 
1200 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  41.29 
 
 
1168 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  40.51 
 
 
1177 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  41.9 
 
 
1200 aa  605  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  39.83 
 
 
1162 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  42.6 
 
 
1174 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  40.97 
 
 
1262 aa  602  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  40.62 
 
 
1182 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  41.72 
 
 
1190 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  41.04 
 
 
1165 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  40.23 
 
 
1201 aa  598  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  41.64 
 
 
1272 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  41.68 
 
 
1279 aa  598  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  42.01 
 
 
1168 aa  598  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  41.41 
 
 
1167 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  39.88 
 
 
1203 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3270  DNA polymerase III subunit alpha  41.16 
 
 
1151 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  41.41 
 
 
1166 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  39.8 
 
 
1228 aa  593  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  41.08 
 
 
1201 aa  595  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2092  DNA polymerase III, alpha subunit  39.88 
 
 
1271 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346877  normal  0.0514777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  40.26 
 
 
1205 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  39.83 
 
 
1183 aa  589  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  39.83 
 
 
1249 aa  589  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  39.61 
 
 
1214 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>