More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4082 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  35.87 
 
 		 1160 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  35.87 
 
 		 1160 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  34.72 
 
 		 1237 aa  645    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  36.77 
 
 		 1170 aa  753    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  40.57 
 
 		 1155 aa  823    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  34.98 
 
 		 1174 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  33.86 
 
 		 1228 aa  667    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  37.22 
 
 		 1149 aa  769    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  35.71 
 
 		 1165 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  35.75 
 
 		 1108 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  34.02 
 
 		 1186 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  36.82 
 
 		 1200 aa  711    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  37.74 
 
 		 1217 aa  769    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  33.8 
 
 		 1158 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.24 
 
 		 1173 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  35.58 
 
 		 1108 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  35.41 
 
 		 1108 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  35.33 
 
 		 1108 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  59.43 
 
 		 1180 aa  1370    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  35 
 
 		 1109 aa  679    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  34.91 
 
 		 1173 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  34.74 
 
 		 1510 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  36.64 
 
 		 1213 aa  682    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  64.74 
 
 		 1188 aa  1560    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  38.13 
 
 		 1172 aa  766    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11580  DNA polymerase III subunit alpha  59.32 
 
 		 1184 aa  1384    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  35.6 
 
 		 1158 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  35.71 
 
 		 1173 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  38.13 
 
 		 1172 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  39.52 
 
 		 1156 aa  812    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  35.93 
 
 		 1160 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  36.74 
 
 		 1173 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  38.86 
 
 		 1172 aa  763    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  36.19 
 
 		 1185 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  40.14 
 
 		 1172 aa  775    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  39.42 
 
 		 1155 aa  827    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  38.26 
 
 		 1165 aa  785    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  34.91 
 
 		 1158 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  35.58 
 
 		 1108 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  38.12 
 
 		 1186 aa  735    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  37.95 
 
 		 1165 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  37 
 
 		 1200 aa  713    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  36.61 
 
 		 1170 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  43.41 
 
 		 1156 aa  914    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  37.22 
 
 		 1165 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  37.23 
 
 		 1210 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 1183 aa  2414    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 1249 aa  2403    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  35.07 
 
 		 1174 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 		 1164 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  34.74 
 
 		 1173 aa  678    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 		 1157 aa  835    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  35.59 
 
 		 1176 aa  676    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  59.41 
 
 		 1183 aa  1379    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  34.52 
 
 		 1159 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1287  DNA polymerase III, alpha subunit  34.66 
 
 		 1158 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  36.21 
 
 		 1168 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  36.98 
 
 		 1168 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  60.14 
 
 		 1191 aa  1392    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  33.74 
 
 		 1163 aa  659    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  38.97 
 
 		 1159 aa  826    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  34.39 
 
 		 1157 aa  661    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  37.45 
 
 		 1165 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  60.14 
 
 		 1191 aa  1392    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.33 
 
 		 1165 aa  836    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  35.97 
 
 		 1155 aa  699    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  36.76 
 
 		 1279 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  34.66 
 
 		 1194 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 		 1158 aa  684    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  33.8 
 
 		 1158 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  33.8 
 
 		 1158 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  35.53 
 
 		 1182 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  33.92 
 
 		 1158 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  40.6 
 
 		 1130 aa  842    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  34.22 
 
 		 1157 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  60.85 
 
 		 1177 aa  1438    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  36.19 
 
 		 1173 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  57.35 
 
 		 1185 aa  1322    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  34.58 
 
 		 1157 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  39.76 
 
 		 1164 aa  806    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  37.17 
 
 		 1195 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  33.97 
 
 		 1158 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  59.56 
 
 		 1190 aa  1366    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  36.49 
 
 		 1331 aa  689    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  38.7 
 
 		 1184 aa  801    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.62 
 
 		 1225 aa  903    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  40.32 
 
 		 1171 aa  784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  55.82 
 
 		 1183 aa  1256    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  33.75 
 
 		 1157 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  60.14 
 
 		 1191 aa  1392    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  35.87 
 
 		 1160 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  60.02 
 
 		 1182 aa  1398    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  34.99 
 
 		 1162 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  36.76 
 
 		 1175 aa  750    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.78 
 
 		 1170 aa  732    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  34.22 
 
 		 1157 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  38.85 
 
 		 1181 aa  838    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  37 
 
 		 1200 aa  714    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  36.29 
 
 		 1183 aa  686    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  38.18 
 
 		 1165 aa  751    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>