More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2068 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  42.26 
 
 
1160 aa  926    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  42.34 
 
 
1160 aa  926    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  42.22 
 
 
1237 aa  848    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  44.63 
 
 
1170 aa  908    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  68.63 
 
 
1155 aa  1660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  42.99 
 
 
1174 aa  936    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  39.91 
 
 
1228 aa  787    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  46.43 
 
 
1149 aa  926    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  44.32 
 
 
1165 aa  964    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  41.74 
 
 
1109 aa  778    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  44 
 
 
1173 aa  841    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  42.4 
 
 
1186 aa  917    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  45.39 
 
 
1200 aa  953    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  44.33 
 
 
1163 aa  846    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  41.61 
 
 
1158 aa  910    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  42.53 
 
 
1173 aa  931    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  45.08 
 
 
1174 aa  861    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  46.47 
 
 
1148 aa  940    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  46.38 
 
 
1148 aa  940    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  42.5 
 
 
1173 aa  935    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  43.09 
 
 
1247 aa  845    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  46.32 
 
 
1156 aa  897    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  38.38 
 
 
1188 aa  784    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  42.11 
 
 
1172 aa  874    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2534  DNA polymerase III subunit alpha  43.97 
 
 
1175 aa  839    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  41.78 
 
 
1123 aa  789    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  46.78 
 
 
1141 aa  933    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  45.31 
 
 
1168 aa  847    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  46.28 
 
 
1158 aa  956    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  42.59 
 
 
1173 aa  939    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  44.57 
 
 
1163 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  60.17 
 
 
1156 aa  1454    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  45.17 
 
 
1176 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  43.15 
 
 
1172 aa  886    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  43.71 
 
 
1172 aa  892    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  69.39 
 
 
1155 aa  1680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  50.83 
 
 
1165 aa  1130    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  46.16 
 
 
1158 aa  939    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  45.59 
 
 
1186 aa  937    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  41.8 
 
 
1165 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  45.83 
 
 
1174 aa  905    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  43.72 
 
 
1170 aa  841    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  49.53 
 
 
1156 aa  1103    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  44.81 
 
 
1278 aa  864    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  46.95 
 
 
1210 aa  1067    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  38.61 
 
 
1183 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  38.69 
 
 
1249 aa  791    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  44.36 
 
 
1151 aa  842    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0922  DNA polymerase III, alpha subunit  41.46 
 
 
1120 aa  794    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  42.22 
 
 
1155 aa  823    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  40.55 
 
 
1185 aa  803    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  45.53 
 
 
1173 aa  938    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  43.63 
 
 
1185 aa  831    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  45.86 
 
 
1149 aa  896    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2893  DNA polymerase III, alpha subunit  42.71 
 
 
1190 aa  783    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.580471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  45.12 
 
 
1193 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  41.9 
 
 
1159 aa  903    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  44.93 
 
 
1151 aa  843    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  43.29 
 
 
1168 aa  944    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  44.23 
 
 
1168 aa  854    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1214  DNA polymerase III, alpha subunit  43.18 
 
 
1247 aa  851    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.69236  normal  0.734793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0754  DNA polymerase III subunit alpha  44.38 
 
 
1176 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291929  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  43.04 
 
 
1163 aa  863    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  48.4 
 
 
1159 aa  988    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  42.74 
 
 
1166 aa  854    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  39.24 
 
 
1162 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  45.27 
 
 
1177 aa  867    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  38.19 
 
 
1191 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.15 
 
 
1165 aa  890    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  43.47 
 
 
1155 aa  942    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  43.5 
 
 
1172 aa  830    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  39.56 
 
 
1194 aa  851    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  42.18 
 
 
1158 aa  939    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  42.3 
 
 
1158 aa  913    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  42.39 
 
 
1158 aa  916    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  44.59 
 
 
1182 aa  946    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  42.41 
 
 
1158 aa  923    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  45.31 
 
 
1130 aa  1014    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  45.44 
 
 
1147 aa  853    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  45.68 
 
 
1177 aa  879    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  43.3 
 
 
1173 aa  944    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  39.42 
 
 
1185 aa  796    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  45.27 
 
 
1177 aa  867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  52.56 
 
 
1164 aa  1231    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  48 
 
 
1195 aa  983    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  42.22 
 
 
1158 aa  912    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  41.02 
 
 
1190 aa  825    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  45.11 
 
 
1331 aa  909    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 
1184 aa  2452    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  43.35 
 
 
1156 aa  847    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  38.45 
 
 
1183 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  42.89 
 
 
1157 aa  934    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  38.19 
 
 
1191 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  41.9 
 
 
1173 aa  889    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  39.27 
 
 
1182 aa  801    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  42.93 
 
 
1162 aa  964    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  52.11 
 
 
1175 aa  1166    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  41.87 
 
 
1190 aa  812    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  42.58 
 
 
1173 aa  796    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  41.75 
 
 
1187 aa  822    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>