More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1192 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  38.46 
 
 
1160 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  38.46 
 
 
1160 aa  791    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  40.14 
 
 
1237 aa  806    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  45.41 
 
 
1170 aa  991    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  46.93 
 
 
1155 aa  1022    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  37.95 
 
 
1174 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  37.97 
 
 
1228 aa  778    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  44.59 
 
 
1149 aa  975    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  38.94 
 
 
1165 aa  814    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  40.23 
 
 
1109 aa  746    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  40.12 
 
 
1108 aa  838    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  38.23 
 
 
1186 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  43.75 
 
 
1200 aa  865    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  37.89 
 
 
1163 aa  744    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  36.86 
 
 
1158 aa  761    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  36.79 
 
 
1173 aa  765    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  40.07 
 
 
1108 aa  839    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  39.98 
 
 
1108 aa  836    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  40.15 
 
 
1108 aa  838    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  39.39 
 
 
1174 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  40.07 
 
 
1148 aa  795    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  40.19 
 
 
1148 aa  798    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  36.96 
 
 
1173 aa  762    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  38.14 
 
 
1247 aa  722    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  36.9 
 
 
1156 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  39.16 
 
 
1188 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  42.54 
 
 
1172 aa  897    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 
1141 aa  751    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  38.39 
 
 
1168 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  40.46 
 
 
1158 aa  831    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  37.29 
 
 
1173 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  39.78 
 
 
1163 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  47.13 
 
 
1156 aa  1016    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  38.78 
 
 
1176 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  42.63 
 
 
1172 aa  880    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0893  DNA polymerase III, alpha subunit  35.88 
 
 
1189 aa  721    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323768  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  42.87 
 
 
1172 aa  880    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  47.11 
 
 
1155 aa  1048    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  46.03 
 
 
1165 aa  988    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  39.23 
 
 
1158 aa  761    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  40.07 
 
 
1108 aa  839    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  43.36 
 
 
1186 aa  856    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  44.82 
 
 
1165 aa  918    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  40.26 
 
 
1174 aa  780    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  40.4 
 
 
1170 aa  792    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  49.79 
 
 
1156 aa  1182    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  42.31 
 
 
1210 aa  916    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  40.55 
 
 
1183 aa  876    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  40.58 
 
 
1249 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  37.31 
 
 
1151 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  39.58 
 
 
1185 aa  719    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  38.29 
 
 
1173 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  37.36 
 
 
1185 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  41.36 
 
 
1149 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  39.93 
 
 
1193 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  37.45 
 
 
1159 aa  752    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  36.48 
 
 
1151 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  40.57 
 
 
1168 aa  816    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  38.3 
 
 
1168 aa  749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  36.79 
 
 
1163 aa  746    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  44.27 
 
 
1159 aa  975    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  38.53 
 
 
1166 aa  717    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  38.29 
 
 
1162 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  38.87 
 
 
1177 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  39.73 
 
 
1191 aa  812    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.73 
 
 
1165 aa  979    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  39.26 
 
 
1155 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  37.97 
 
 
1172 aa  724    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  39.17 
 
 
1194 aa  823    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0340  DNA polymerase III, alpha subunit, interruption-C  57.95 
 
 
783 aa  910    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  38.7 
 
 
1158 aa  778    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  37.79 
 
 
1158 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  37.7 
 
 
1158 aa  770    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  38.18 
 
 
1182 aa  801    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  37.36 
 
 
1158 aa  759    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  48.96 
 
 
1130 aa  1107    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  38.68 
 
 
1177 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  38.43 
 
 
1173 aa  805    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  40.4 
 
 
1185 aa  849    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  38.87 
 
 
1177 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  45.71 
 
 
1164 aa  1038    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  41.78 
 
 
1195 aa  840    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  37.84 
 
 
1158 aa  771    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  43.43 
 
 
1190 aa  928    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  42.78 
 
 
1331 aa  858    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  45.83 
 
 
1184 aa  1014    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  38.82 
 
 
1183 aa  817    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  37.28 
 
 
1157 aa  774    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  39.73 
 
 
1191 aa  812    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  37.53 
 
 
1173 aa  741    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  39.8 
 
 
1182 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  40.41 
 
 
1162 aa  819    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  45.72 
 
 
1175 aa  978    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  39.71 
 
 
1173 aa  730    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  38.71 
 
 
1187 aa  718    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  39.2 
 
 
1161 aa  721    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  39.39 
 
 
1686 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  44.03 
 
 
1200 aa  872    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  38.57 
 
 
1183 aa  816    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  43.92 
 
 
1165 aa  911    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>