More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4709 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  35.9 
 
 		 1160 aa  708    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  35.9 
 
 		 1160 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  36.6 
 
 		 1237 aa  728    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  38.83 
 
 		 1170 aa  736    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  39.55 
 
 		 1155 aa  778    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  36.18 
 
 		 1174 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  47.46 
 
 		 1228 aa  1071    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  39.17 
 
 		 1149 aa  800    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  35.13 
 
 		 1165 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  33.93 
 
 		 1183 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  37.11 
 
 		 1173 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  34.81 
 
 		 1108 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  35.1 
 
 		 1186 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  38.72 
 
 		 1200 aa  727    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  36.58 
 
 		 1163 aa  697    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  34.58 
 
 		 1158 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.34 
 
 		 1173 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  34.81 
 
 		 1108 aa  668    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  34.64 
 
 		 1108 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  34.64 
 
 		 1108 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  36.17 
 
 		 1148 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  36.26 
 
 		 1148 aa  683    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  35.28 
 
 		 1173 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  35.57 
 
 		 1247 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  35.5 
 
 		 1188 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  37.02 
 
 		 1172 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  36.17 
 
 		 1141 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  37.73 
 
 		 1168 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.7 
 
 		 1158 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  35.37 
 
 		 1173 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  37.03 
 
 		 1163 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  41.02 
 
 		 1156 aa  797    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  35 
 
 		 1176 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1262  DNA polymerase III, alpha subunit  34.31 
 
 		 1188 aa  680    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.875559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  37.91 
 
 		 1172 aa  733    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0893  DNA polymerase III, alpha subunit  34.7 
 
 		 1189 aa  696    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323768  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  37.38 
 
 		 1172 aa  724    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  39.78 
 
 		 1155 aa  795    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  36.85 
 
 		 1165 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  35.95 
 
 		 1158 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  34.81 
 
 		 1108 aa  668    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  37.88 
 
 		 1186 aa  717    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  37.13 
 
 		 1165 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  35.91 
 
 		 1174 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  35.63 
 
 		 1170 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  40.63 
 
 		 1156 aa  795    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1210 aa  731    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  35.26 
 
 		 1183 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1249 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  36.59 
 
 		 1151 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  36.54 
 
 		 1155 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  34.44 
 
 		 1185 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  36.71 
 
 		 1173 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  35.72 
 
 		 1185 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  36.84 
 
 		 1149 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  48.77 
 
 		 1454 aa  1181    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  34.57 
 
 		 1159 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  36.32 
 
 		 1151 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  35.57 
 
 		 1168 aa  670    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  37.43 
 
 		 1168 aa  696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1214  DNA polymerase III, alpha subunit  35.72 
 
 		 1247 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.69236  normal  0.734793 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  37.69 
 
 		 1165 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  37.4 
 
 		 1159 aa  738    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  35.74 
 
 		 1166 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  37.39 
 
 		 1171 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  36.7 
 
 		 1191 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.35 
 
 		 1165 aa  790    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  34.81 
 
 		 1155 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  37.43 
 
 		 1172 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  63.11 
 
 		 1194 aa  1530    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  33.5 
 
 		 1158 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  34.84 
 
 		 1158 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  34.84 
 
 		 1158 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  34.7 
 
 		 1182 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  36.27 
 
 		 1158 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  37.73 
 
 		 1130 aa  771    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  37.08 
 
 		 1147 aa  673    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3236  DNA polymerase III subunit alpha  37.03 
 
 		 1163 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  35.82 
 
 		 1173 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  35.64 
 
 		 1185 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  40.3 
 
 		 1181 aa  808    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  38.62 
 
 		 1164 aa  776    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  37.01 
 
 		 1195 aa  694    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  34.76 
 
 		 1158 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  37.02 
 
 		 1190 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  39.89 
 
 		 1331 aa  704    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  38.7 
 
 		 1184 aa  796    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1195  DNA polymerase III, alpha subunit  36.22 
 
 		 1190 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  36.23 
 
 		 1156 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  35.01 
 
 		 1183 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  34.14 
 
 		 1157 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  36.7 
 
 		 1191 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  36.85 
 
 		 1172 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  35.49 
 
 		 1182 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  35.58 
 
 		 1162 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  37.82 
 
 		 1175 aa  718    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  37.67 
 
 		 1190 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  37.25 
 
 		 1187 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  34.06 
 
 		 1161 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  37.14 
 
 		 1165 aa  711    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>