More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1195 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  35.51 
 
 		 1160 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  35.51 
 
 		 1160 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  36.54 
 
 		 1181 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  36.58 
 
 		 1170 aa  673    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  36.11 
 
 		 1155 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  35 
 
 		 1174 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  33.8 
 
 		 1228 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  38.75 
 
 		 1149 aa  760    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  35.8 
 
 		 1165 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.26 
 
 		 1170 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  36.12 
 
 		 1173 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  37.51 
 
 		 1686 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  33.91 
 
 		 1186 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  37.09 
 
 		 1200 aa  650    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  35.83 
 
 		 1163 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  34.1 
 
 		 1158 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.38 
 
 		 1173 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  37.18 
 
 		 1200 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  35.31 
 
 		 1183 aa  674    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  36.26 
 
 		 1171 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  37.51 
 
 		 1174 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  38.51 
 
 		 1148 aa  739    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  38.55 
 
 		 1148 aa  744    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  35.19 
 
 		 1173 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  37.54 
 
 		 1157 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  34.46 
 
 		 1156 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  35.08 
 
 		 1174 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2534  DNA polymerase III subunit alpha  35.36 
 
 		 1175 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  37.51 
 
 		 1174 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  35.99 
 
 		 1141 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  35.36 
 
 		 1168 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.09 
 
 		 1158 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  36.13 
 
 		 1173 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  36.47 
 
 		 1163 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  37.44 
 
 		 1156 aa  737    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  36.7 
 
 		 1176 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1262  DNA polymerase III, alpha subunit  76.72 
 
 		 1188 aa  1905    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.875559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  35.79 
 
 		 1172 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0893  DNA polymerase III, alpha subunit  75.4 
 
 		 1189 aa  1867    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323768  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  35.36 
 
 		 1172 aa  645    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  35.51 
 
 		 1155 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  36.68 
 
 		 1165 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  34.94 
 
 		 1158 aa  663    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  34.56 
 
 		 1454 aa  646    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3236  DNA polymerase III subunit alpha  36.47 
 
 		 1163 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  35.65 
 
 		 1176 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  36.77 
 
 		 1174 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  34.16 
 
 		 1157 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  39.49 
 
 		 1156 aa  767    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  37.51 
 
 		 1278 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1210 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  35.8 
 
 		 1164 aa  721    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  35.83 
 
 		 1163 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  39.15 
 
 		 1225 aa  755    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  33.72 
 
 		 1157 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  37.51 
 
 		 1174 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  35.26 
 
 		 1185 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  35.43 
 
 		 1173 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 		 1185 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  34.83 
 
 		 1149 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  37.6 
 
 		 1274 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  37.06 
 
 		 1193 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  34.45 
 
 		 1159 aa  681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  35.79 
 
 		 1151 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  36.45 
 
 		 1168 aa  704    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  35.66 
 
 		 1168 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  33.36 
 
 		 1510 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0754  DNA polymerase III subunit alpha  35.16 
 
 		 1176 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  34.48 
 
 		 1163 aa  649    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  35.63 
 
 		 1159 aa  716    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  35.48 
 
 		 1166 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  37.51 
 
 		 1174 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  37.14 
 
 		 1177 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3949  DNA polymerase III subunit alpha  36.2 
 
 		 1163 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  unclonable  0.0040384  normal  0.125075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  34.57 
 
 		 1155 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  35.2 
 
 		 1160 aa  700    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  34.46 
 
 		 1194 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  35.54 
 
 		 1158 aa  701    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  34.07 
 
 		 1158 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  34.15 
 
 		 1158 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  34.94 
 
 		 1182 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  34.57 
 
 		 1158 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  37.78 
 
 		 1130 aa  721    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  38.68 
 
 		 1147 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  35.82 
 
 		 1177 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  34.8 
 
 		 1173 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  37.14 
 
 		 1177 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  36.26 
 
 		 1164 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  36.86 
 
 		 1195 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  34.15 
 
 		 1158 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  35.5 
 
 		 1187 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  34.41 
 
 		 1157 aa  689    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  36.52 
 
 		 1184 aa  723    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1195  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1190 aa  2449    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  35.42 
 
 		 1156 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  33.94 
 
 		 1157 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  36.18 
 
 		 1173 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  35.6 
 
 		 1186 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  36.18 
 
 		 1162 aa  720    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  35.06 
 
 		 1175 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>