More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1889 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3682  DNA polymerase III subunit alpha  75.42 
 
 		 874 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.362078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2428  DNA polymerase III subunit alpha  75.42 
 
 		 874 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  61.58 
 
 		 1165 aa  940    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  62.14 
 
 		 1172 aa  947    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  62 
 
 		 1171 aa  944    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1603  DNA polymerase III subunit alpha  72.12 
 
 		 877 aa  1117    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  70.14 
 
 		 1162 aa  1060    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  63.38 
 
 		 1171 aa  967    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  62.83 
 
 		 1172 aa  967    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  62.97 
 
 		 1172 aa  962    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  61.3 
 
 		 1165 aa  938    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2199  DNA polymerase III subunit alpha  66.71 
 
 		 870 aa  1019    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.16253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  44.95 
 
 		 1156 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  61.3 
 
 		 1165 aa  937    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3404  DNA polymerase III subunit alpha  76.7 
 
 		 876 aa  1168    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.605103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  100 
 
 		 2684 aa  5564    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  62.14 
 
 		 1172 aa  949    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  60.89 
 
 		 1165 aa  935    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4135  DNA polymerase III subunit alpha  72.08 
 
 		 877 aa  1099    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.14344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  45.44 
 
 		 1075 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  45.1 
 
 		 1127 aa  628  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  37.25 
 
 		 1607 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  43.92 
 
 		 1139 aa  629  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  44.41 
 
 		 1145 aa  622  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  45.23 
 
 		 1134 aa  623  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  43.08 
 
 		 1225 aa  620  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  43.43 
 
 		 1130 aa  618  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  45.24 
 
 		 1145 aa  613  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  44.28 
 
 		 1139 aa  602  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  43.22 
 
 		 1155 aa  599  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  43.63 
 
 		 1165 aa  596  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  43.91 
 
 		 1181 aa  592  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  41.68 
 
 		 1174 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  42.8 
 
 		 1179 aa  582  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  42.62 
 
 		 1157 aa  582  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  41.73 
 
 		 1155 aa  580  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  42.66 
 
 		 1156 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  41.97 
 
 		 1173 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  42 
 
 		 1184 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  42.29 
 
 		 1186 aa  572  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  40.9 
 
 		 1159 aa  574  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  41.94 
 
 		 1175 aa  573  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  41.91 
 
 		 1165 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  44.55 
 
 		 1161 aa  568  1e-160  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  41.15 
 
 		 1165 aa  570  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  41.58 
 
 		 1151 aa  567  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  42.84 
 
 		 1190 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  41.14 
 
 		 1132 aa  563  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  41.24 
 
 		 1160 aa  562  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  42.07 
 
 		 1148 aa  563  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  40.54 
 
 		 1164 aa  559  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  41.85 
 
 		 1159 aa  557  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  42.4 
 
 		 1159 aa  554  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  41.91 
 
 		 1180 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  42.56 
 
 		 1170 aa  553  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  40.62 
 
 		 1155 aa  553  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  42.29 
 
 		 1170 aa  552  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.29 
 
 		 1170 aa  553  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  41.14 
 
 		 1167 aa  553  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  40.3 
 
 		 1156 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  41.33 
 
 		 1122 aa  549  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  41.96 
 
 		 1149 aa  545  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  39.35 
 
 		 1240 aa  545  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  40.71 
 
 		 1200 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  39.62 
 
 		 1217 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  40.37 
 
 		 1186 aa  537  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  39.46 
 
 		 1210 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2092  DNA polymerase III, alpha subunit  40.26 
 
 		 1271 aa  540  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346877  normal  0.0514777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  40.71 
 
 		 1200 aa  539  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  41.55 
 
 		 1148 aa  535  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  40.45 
 
 		 1200 aa  537  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  39.11 
 
 		 1210 aa  537  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  40.59 
 
 		 1190 aa  534  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0892  DNA polymerase III subunit alpha  40.88 
 
 		 1197 aa  535  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0260823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  39.76 
 
 		 1194 aa  532  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  38.97 
 
 		 1210 aa  533  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  40 
 
 		 1182 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  40.51 
 
 		 1182 aa  529  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  39.52 
 
 		 1189 aa  530  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  40.27 
 
 		 1201 aa  530  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  40.88 
 
 		 1167 aa  527  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0531  DNA polymerase III, alpha subunit  39.9 
 
 		 1205 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  40 
 
 		 1201 aa  525  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  40.88 
 
 		 1166 aa  527  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  39.18 
 
 		 1214 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  39.58 
 
 		 1188 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  38.97 
 
 		 1213 aa  524  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  40.3 
 
 		 1260 aa  523  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  39.97 
 
 		 1195 aa  522  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  39.25 
 
 		 1228 aa  520  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  41.12 
 
 		 1279 aa  520  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  40.85 
 
 		 1272 aa  519  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  39.34 
 
 		 1203 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  39.34 
 
 		 1162 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  40.03 
 
 		 1296 aa  519  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  39.86 
 
 		 1178 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  38.5 
 
 		 1182 aa  516  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  40.16 
 
 		 1331 aa  515  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  39.09 
 
 		 1177 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  40.72 
 
 		 1143 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>