More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1612 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  36.12 
 
 
1160 aa  687    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  36.12 
 
 
1160 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  34.46 
 
 
1237 aa  678    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  38.38 
 
 
1170 aa  702    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  42.24 
 
 
1155 aa  873    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  36.31 
 
 
1174 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  37.38 
 
 
1172 aa  709    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  38.91 
 
 
1149 aa  780    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 
1165 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  34.58 
 
 
1157 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  35.33 
 
 
1186 aa  668    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  40.16 
 
 
1200 aa  743    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  36.12 
 
 
1163 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  34.82 
 
 
1158 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  36.21 
 
 
1173 aa  698    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  35.7 
 
 
1183 aa  699    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  37.86 
 
 
1165 aa  722    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  40.12 
 
 
1200 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  37.54 
 
 
1165 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  37.26 
 
 
1148 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  37.26 
 
 
1148 aa  671    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  36.61 
 
 
1173 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  34.82 
 
 
1156 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 
1188 aa  709    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  37.3 
 
 
1172 aa  710    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  36.2 
 
 
1183 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  37.85 
 
 
1123 aa  643    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  35.44 
 
 
1141 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  37.18 
 
 
1168 aa  700    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  37.42 
 
 
1158 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  35.37 
 
 
1173 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  36.94 
 
 
1165 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  43.42 
 
 
1156 aa  864    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  37.23 
 
 
1176 aa  721    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  36.58 
 
 
1172 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  37.21 
 
 
1510 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  36.32 
 
 
1172 aa  732    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  41.76 
 
 
1155 aa  883    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  40.92 
 
 
1165 aa  808    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  35.97 
 
 
1158 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  35.66 
 
 
1160 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  39.53 
 
 
1186 aa  731    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  37.35 
 
 
1165 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  40.6 
 
 
1225 aa  789    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  36.31 
 
 
1170 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  41.29 
 
 
1156 aa  841    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  36.53 
 
 
1157 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  39.92 
 
 
1210 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  35.03 
 
 
1183 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  35.29 
 
 
1249 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  37.19 
 
 
1151 aa  697    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  36.31 
 
 
1174 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  34.57 
 
 
1173 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  37.34 
 
 
1185 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  36.03 
 
 
1163 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  36.5 
 
 
1171 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  35.85 
 
 
1157 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  34.75 
 
 
1454 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  37.28 
 
 
1151 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  35.77 
 
 
1168 aa  680    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  37.64 
 
 
1168 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  37.32 
 
 
1177 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  35.38 
 
 
1163 aa  644    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  38.47 
 
 
1159 aa  773    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  37.94 
 
 
1191 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  43.44 
 
 
1157 aa  892    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  37.94 
 
 
1191 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  37.33 
 
 
1165 aa  721    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  36.35 
 
 
1155 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  35.44 
 
 
1172 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  39.21 
 
 
1194 aa  738    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  36.38 
 
 
1158 aa  687    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  34.56 
 
 
1158 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  34.56 
 
 
1158 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  36.84 
 
 
1182 aa  726    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  35.77 
 
 
1158 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  39.12 
 
 
1130 aa  757    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  36.02 
 
 
1147 aa  669    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  38.04 
 
 
1170 aa  688    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  36.87 
 
 
1173 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  38.67 
 
 
1185 aa  691    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  36.17 
 
 
1173 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  40.73 
 
 
1164 aa  870    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  36.88 
 
 
1195 aa  725    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  34.39 
 
 
1158 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  37.31 
 
 
1190 aa  739    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  40.53 
 
 
1331 aa  754    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  43.56 
 
 
1184 aa  869    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  34.01 
 
 
1156 aa  638    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  34.86 
 
 
1183 aa  675    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  34.89 
 
 
1157 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  37.94 
 
 
1191 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  36.36 
 
 
1173 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  36.27 
 
 
1182 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  35.17 
 
 
1162 aa  697    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  42.64 
 
 
1175 aa  822    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  34.67 
 
 
1190 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  39.58 
 
 
1181 aa  788    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  34.55 
 
 
1187 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  37.37 
 
 
1161 aa  657    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>