More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1638 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  36.8 
 
 		 1160 aa  688    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  36.72 
 
 		 1160 aa  688    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  36.67 
 
 		 1237 aa  719    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  41.89 
 
 		 1170 aa  841    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  42.52 
 
 		 1155 aa  859    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  36.05 
 
 		 1174 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  36.83 
 
 		 1228 aa  738    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  39.57 
 
 		 1149 aa  808    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  38.27 
 
 		 1165 aa  702    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  39.06 
 
 		 1109 aa  651    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  36.9 
 
 		 1108 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  35.56 
 
 		 1186 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  36.45 
 
 		 1200 aa  731    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  38.84 
 
 		 1163 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  35.49 
 
 		 1158 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  36.69 
 
 		 1173 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  36.65 
 
 		 1108 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  36.65 
 
 		 1108 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  36.56 
 
 		 1108 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  36.83 
 
 		 1148 aa  701    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  36.42 
 
 		 1148 aa  704    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  36.67 
 
 		 1173 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  36.79 
 
 		 1156 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  45.23 
 
 		 1188 aa  998    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  39.97 
 
 		 1172 aa  810    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  37.04 
 
 		 1123 aa  639    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  37.1 
 
 		 1141 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  39.66 
 
 		 1168 aa  701    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  38.24 
 
 		 1158 aa  713    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  35.96 
 
 		 1173 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  37.42 
 
 		 1163 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  40.48 
 
 		 1156 aa  839    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1262  DNA polymerase III, alpha subunit  35.82 
 
 		 1188 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.875559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  42.5 
 
 		 1172 aa  834    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0893  DNA polymerase III, alpha subunit  35.65 
 
 		 1189 aa  654    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323768  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  42.97 
 
 		 1172 aa  845    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  42.07 
 
 		 1155 aa  863    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  40.78 
 
 		 1165 aa  814    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  35.67 
 
 		 1158 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  36.65 
 
 		 1108 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  39.54 
 
 		 1186 aa  816    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  39.36 
 
 		 1165 aa  816    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  36.81 
 
 		 1174 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  40.25 
 
 		 1170 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  45.51 
 
 		 1156 aa  977    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  41 
 
 		 1210 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  47.59 
 
 		 1183 aa  1007    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  47.59 
 
 		 1249 aa  1006    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  37.79 
 
 		 1151 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0922  DNA polymerase III, alpha subunit  37.09 
 
 		 1120 aa  647    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  36.67 
 
 		 1173 aa  704    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  39.32 
 
 		 1185 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  37.57 
 
 		 1149 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  37.09 
 
 		 1193 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  35.99 
 
 		 1454 aa  671    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  39.04 
 
 		 1151 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  39.15 
 
 		 1168 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  39.5 
 
 		 1168 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  35.36 
 
 		 1163 aa  672    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  39.27 
 
 		 1159 aa  830    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  36.84 
 
 		 1166 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  38.3 
 
 		 1162 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  45.21 
 
 		 1191 aa  965    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.79 
 
 		 1165 aa  863    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  35.01 
 
 		 1155 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  37.47 
 
 		 1172 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  37.68 
 
 		 1194 aa  736    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  36.59 
 
 		 1158 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  34.51 
 
 		 1158 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  34.51 
 
 		 1158 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  38.86 
 
 		 1182 aa  690    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  35.5 
 
 		 1158 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  43.63 
 
 		 1130 aa  912    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  39.35 
 
 		 1147 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  37.21 
 
 		 1173 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  44.59 
 
 		 1185 aa  942    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2252  DNA polymerase III, alpha subunit  37.95 
 
 		 1174 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.353528  normal  0.94108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  41.65 
 
 		 1164 aa  858    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  39.37 
 
 		 1195 aa  737    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  34.43 
 
 		 1158 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  50.08 
 
 		 1190 aa  1095    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  37.42 
 
 		 1331 aa  729    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  42.54 
 
 		 1184 aa  831    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  36.56 
 
 		 1156 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  44.47 
 
 		 1183 aa  921    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  36.43 
 
 		 1157 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  45.21 
 
 		 1191 aa  965    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  36.1 
 
 		 1173 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  45 
 
 		 1182 aa  970    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  37.62 
 
 		 1162 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  40.22 
 
 		 1175 aa  836    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  37.86 
 
 		 1190 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  37.39 
 
 		 1187 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  37.02 
 
 		 1161 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  37.87 
 
 		 1186 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  36.54 
 
 		 1200 aa  732    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  40.22 
 
 		 1183 aa  709    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  39.79 
 
 		 1165 aa  819    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  38.58 
 
 		 1165 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  39.93 
 
 		 1172 aa  807    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>