More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2499 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  39.02 
 
 
1160 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  39.02 
 
 
1160 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  65.13 
 
 
1272 aa  1635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  44.21 
 
 
1170 aa  899    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  40.46 
 
 
1155 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  37.05 
 
 
1174 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  36.38 
 
 
1228 aa  663    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  39.42 
 
 
1149 aa  781    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  38.02 
 
 
1165 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  39.58 
 
 
1165 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  38.31 
 
 
1108 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  36.04 
 
 
1186 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  35.47 
 
 
1200 aa  651    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  39.02 
 
 
1160 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  37.58 
 
 
1158 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  37.19 
 
 
1173 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  38.31 
 
 
1108 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  38.31 
 
 
1108 aa  677    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  38.31 
 
 
1108 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  37.68 
 
 
1183 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  37.66 
 
 
1109 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11580  DNA polymerase III subunit alpha  38.8 
 
 
1184 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  37.21 
 
 
1173 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  39.29 
 
 
1165 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  35.85 
 
 
1188 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  39.91 
 
 
1172 aa  800    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.88 
 
 
1225 aa  847    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  40.54 
 
 
1181 aa  853    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  37.09 
 
 
1157 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.36 
 
 
1158 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  36.92 
 
 
1173 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  40 
 
 
1172 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  39.93 
 
 
1156 aa  761    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  37.14 
 
 
1174 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1262  DNA polymerase III, alpha subunit  37.19 
 
 
1188 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.875559  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  41.35 
 
 
1172 aa  823    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  37.48 
 
 
1180 aa  714    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  42.11 
 
 
1172 aa  839    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  40.28 
 
 
1155 aa  797    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  39.13 
 
 
1165 aa  747    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  38.89 
 
 
1160 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  38.31 
 
 
1108 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  37.07 
 
 
1186 aa  692    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  39.31 
 
 
1165 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  37.2 
 
 
1201 aa  698    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  38.51 
 
 
1177 aa  742    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  44.93 
 
 
1156 aa  862    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  36.85 
 
 
1217 aa  716    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  39.15 
 
 
1210 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  35.23 
 
 
1183 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  35.23 
 
 
1249 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  35.69 
 
 
1213 aa  680    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  36.45 
 
 
1173 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  38.5 
 
 
1191 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  36.44 
 
 
1164 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4284  DNA polymerase III subunit alpha  37.43 
 
 
1150 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.166792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  36.99 
 
 
1159 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  35.36 
 
 
1168 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.64 
 
 
1170 aa  898    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  36.21 
 
 
1157 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  35.53 
 
 
1163 aa  639    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  38.7 
 
 
1159 aa  764    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  41.98 
 
 
1171 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  37.72 
 
 
1185 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  38.5 
 
 
1191 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.65 
 
 
1165 aa  809    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  37.5 
 
 
1155 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  39.46 
 
 
1157 aa  750    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  36.01 
 
 
1194 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  37.05 
 
 
1158 aa  667    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  38.23 
 
 
1158 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  38.13 
 
 
1158 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  37.32 
 
 
1182 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  39.02 
 
 
1160 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  42.78 
 
 
1130 aa  816    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  35.57 
 
 
1143 aa  651    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  65.89 
 
 
1279 aa  1654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  37.62 
 
 
1173 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  37.64 
 
 
1185 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  36.21 
 
 
1157 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  39.64 
 
 
1164 aa  781    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  39.32 
 
 
1195 aa  708    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  38.28 
 
 
1158 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  40.12 
 
 
1190 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  35.99 
 
 
1331 aa  669    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  39.95 
 
 
1184 aa  765    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  35.41 
 
 
1183 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  37.86 
 
 
1157 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  38.5 
 
 
1191 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  35.28 
 
 
1200 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  38.03 
 
 
1182 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  38.42 
 
 
1162 aa  693    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  40.48 
 
 
1175 aa  768    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  37.44 
 
 
1165 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  37.95 
 
 
1160 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  37.52 
 
 
1176 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  37.64 
 
 
1157 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  35.37 
 
 
1200 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  37.73 
 
 
1183 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  39.49 
 
 
1165 aa  798    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>