More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1784 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  36.58 
 
 		 1160 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  36.53 
 
 		 1160 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  35.88 
 
 		 1237 aa  652    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  38.99 
 
 		 1170 aa  789    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  40.54 
 
 		 1155 aa  829    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  36.33 
 
 		 1174 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  34.87 
 
 		 1228 aa  683    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  37.71 
 
 		 1149 aa  770    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  38.67 
 
 		 1165 aa  743    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  96.26 
 
 		 1177 aa  2345    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  35.53 
 
 		 1108 aa  693    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  35.21 
 
 		 1186 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  37.17 
 
 		 1200 aa  737    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  38.04 
 
 		 1163 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  36.3 
 
 		 1158 aa  687    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.86 
 
 		 1173 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  35.11 
 
 		 1108 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  35.03 
 
 		 1108 aa  684    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  34.94 
 
 		 1108 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  39.91 
 
 		 1165 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  34.39 
 
 		 1148 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  34.23 
 
 		 1148 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  35.77 
 
 		 1173 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  36.21 
 
 		 1156 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  58.99 
 
 		 1188 aa  1412    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  40.47 
 
 		 1172 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  39.87 
 
 		 1181 aa  845    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  39.73 
 
 		 1165 aa  775    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  35.24 
 
 		 1141 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  38.53 
 
 		 1168 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  36.9 
 
 		 1158 aa  726    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  35.91 
 
 		 1173 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  41.4 
 
 		 1171 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  41.27 
 
 		 1156 aa  841    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  36.64 
 
 		 1176 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  40.48 
 
 		 1172 aa  794    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  37.17 
 
 		 1200 aa  736    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  40.27 
 
 		 1172 aa  800    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  40.03 
 
 		 1155 aa  833    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  39.91 
 
 		 1165 aa  817    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  36.5 
 
 		 1158 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  35.11 
 
 		 1108 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  37.82 
 
 		 1186 aa  735    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  39.58 
 
 		 1165 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  36.3 
 
 		 1174 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  38.34 
 
 		 1170 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  43.53 
 
 		 1156 aa  925    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  60.03 
 
 		 1191 aa  1432    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  40.67 
 
 		 1210 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  60.59 
 
 		 1183 aa  1419    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  60.59 
 
 		 1249 aa  1420    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  37.96 
 
 		 1151 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  40.61 
 
 		 1172 aa  792    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  39.49 
 
 		 1165 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  35.69 
 
 		 1173 aa  693    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  36.1 
 
 		 1157 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  36.56 
 
 		 1149 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  36.32 
 
 		 1157 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  36.17 
 
 		 1159 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  37.44 
 
 		 1151 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  36.45 
 
 		 1168 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  36.86 
 
 		 1168 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  37.94 
 
 		 1183 aa  729    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  60.17 
 
 		 1183 aa  1437    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  40.85 
 
 		 1159 aa  856    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  36.61 
 
 		 1166 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  36.26 
 
 		 1157 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  36.55 
 
 		 1177 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  60.03 
 
 		 1191 aa  1432    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.39 
 
 		 1165 aa  880    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  38.09 
 
 		 1155 aa  716    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  37.29 
 
 		 1172 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  35.77 
 
 		 1194 aa  707    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  36.72 
 
 		 1158 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  36.3 
 
 		 1158 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  36.3 
 
 		 1158 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  37.36 
 
 		 1182 aa  715    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  36.93 
 
 		 1158 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  42.49 
 
 		 1130 aa  884    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  37.57 
 
 		 1147 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  36.24 
 
 		 1177 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  37.6 
 
 		 1173 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  60.24 
 
 		 1185 aa  1413    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  36.55 
 
 		 1177 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  40.75 
 
 		 1164 aa  855    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  38.24 
 
 		 1195 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  36.35 
 
 		 1158 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  63.14 
 
 		 1190 aa  1493    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  37.81 
 
 		 1331 aa  707    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  38.67 
 
 		 1184 aa  829    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  41.6 
 
 		 1225 aa  895    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  59.25 
 
 		 1183 aa  1381    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  35.82 
 
 		 1157 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  60.03 
 
 		 1191 aa  1432    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  37.86 
 
 		 1176 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  59.34 
 
 		 1182 aa  1432    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  35.57 
 
 		 1162 aa  700    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  40.08 
 
 		 1175 aa  804    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  35.99 
 
 		 1190 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  36.7 
 
 		 1160 aa  700    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>