More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0266 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  100 
 
 		 413 aa  838    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  44.69 
 
 		 418 aa  354  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  42.99 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  42.96 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  41.61 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  42.23 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  40.69 
 
 		 443 aa  292  6e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  40.51 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  37.47 
 
 		 484 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  38.66 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  36.97 
 
 		 482 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  38.16 
 
 		 474 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  35.73 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  34.32 
 
 		 467 aa  237  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  34.5 
 
 		 642 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  33.59 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  36.47 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  35.37 
 
 		 507 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  33.93 
 
 		 497 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  34.61 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  34.79 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  35.87 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  36.01 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  35.31 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  34.87 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  32.15 
 
 		 483 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  35.45 
 
 		 481 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  32.23 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25.96 
 
 		 892 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  31.5 
 
 		 1092 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  26.8 
 
 		 764 aa  120  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  26.36 
 
 		 1001 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  30.4 
 
 		 942 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  30.43 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.8 
 
 		 332 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.29 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  31.8 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.69 
 
 		 322 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  32.51 
 
 		 322 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  28.16 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  32.72 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  31.8 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.14 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  28.67 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28.12 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  27.51 
 
 		 315 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  33.18 
 
 		 324 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  27.38 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.03 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  31.65 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  28.4 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  28.4 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  31.22 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  30.2 
 
 		 326 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.64 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.83 
 
 		 289 aa  91.3  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.65 
 
 		 317 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.48 
 
 		 329 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  30.25 
 
 		 322 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  28.57 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.48 
 
 		 329 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  28.11 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  28.69 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  29.27 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  29.38 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  27.31 
 
 		 235 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  28.57 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  27.94 
 
 		 327 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  31.31 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  32.86 
 
 		 326 aa  86.3  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  24.08 
 
 		 993 aa  83.2  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  27.45 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  28.52 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.27 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  26.02 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  29.68 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  30.97 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  25.45 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.96 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.69 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  27.31 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  27.14 
 
 		 1015 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  28.69 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  30.38 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  26.8 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  30 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.89 
 
 		 735 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  24.03 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  27.95 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.21 
 
 		 562 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  25.96 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  25.69 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  27.43 
 
 		 599 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  27.51 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.12 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  28.38 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.12 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  22.7 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  22.55 
 
 		 562 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  26.75 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>