More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2909 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
687 aa  1351    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  57.05 
 
 
614 aa  625  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.67 
 
 
659 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.87 
 
 
580 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.52 
 
 
613 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.84 
 
 
626 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.61 
 
 
628 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.05 
 
 
592 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.86 
 
 
622 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.35 
 
 
587 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.84 
 
 
582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.05 
 
 
582 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0462  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.28 
 
 
615 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.91 
 
 
623 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
611 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.62 
 
 
584 aa  435  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.44 
 
 
608 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.54 
 
 
623 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.81 
 
 
626 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.83 
 
 
631 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.77 
 
 
651 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.19 
 
 
624 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.32 
 
 
625 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.79 
 
 
634 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.17 
 
 
628 aa  429  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.58 
 
 
582 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.29 
 
 
600 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.07 
 
 
623 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.65 
 
 
602 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.61 
 
 
605 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.48 
 
 
602 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  55.64 
 
 
565 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.09 
 
 
625 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  55.1 
 
 
618 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.48 
 
 
637 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.22 
 
 
627 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.35 
 
 
573 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.1 
 
 
605 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.58 
 
 
632 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.61 
 
 
606 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.35 
 
 
533 aa  340  7e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.68 
 
 
505 aa  333  6e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  38.93 
 
 
491 aa  327  7e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  43.44 
 
 
605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.88 
 
 
731 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.3 
 
 
642 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.23 
 
 
716 aa  301  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.3 
 
 
642 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.3 
 
 
642 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.48 
 
 
579 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.3 
 
 
642 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.96 
 
 
614 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.61 
 
 
948 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.68 
 
 
551 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.11 
 
 
728 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.37 
 
 
1137 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.18 
 
 
642 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 
955 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 
580 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.62 
 
 
587 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
751 aa  297  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.08 
 
 
642 aa  297  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.4 
 
 
1113 aa  296  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.69 
 
 
795 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.78 
 
 
678 aa  296  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.65 
 
 
606 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.67 
 
 
1115 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.4 
 
 
957 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.71 
 
 
579 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.21 
 
 
658 aa  295  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.23 
 
 
914 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.67 
 
 
1045 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.67 
 
 
1040 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.93 
 
 
658 aa  294  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.6 
 
 
911 aa  294  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.5 
 
 
679 aa  294  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.84 
 
 
1147 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.72 
 
 
690 aa  294  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.93 
 
 
658 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.67 
 
 
1071 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  44.41 
 
 
648 aa  294  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.84 
 
 
1137 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.86 
 
 
579 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  43.5 
 
 
643 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.85 
 
 
591 aa  293  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.5 
 
 
643 aa  293  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.09 
 
 
647 aa  293  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.44 
 
 
685 aa  293  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.32 
 
 
681 aa  293  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.9 
 
 
1002 aa  292  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.87 
 
 
664 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.84 
 
 
601 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.75 
 
 
730 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>