52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33013 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  100 
 
 		 571 aa  1176    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31479  predicted protein  23.96 
 
 		 593 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  21.12 
 
 		 497 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28605  predicted protein  26.67 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04200  RAD17 isoform 4, putative  23.66 
 
 		 789 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  24.37 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  22.42 
 
 		 454 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08876  cell cycle checkpoint protein Rad17, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02820)  24.49 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00362415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  23.08 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  22.9 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  21.54 
 
 		 514 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  22.73 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  21.02 
 
 		 642 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  25.1 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  21.22 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  23.36 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  22.58 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  20.09 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  19.57 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  21.51 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  23.08 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  20.22 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  22.18 
 
 		 484 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  20.55 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  20.44 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  21.17 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  21.09 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  20.68 
 
 		 1001 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  21.69 
 
 		 321 aa  54.3  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  23.43 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  19.63 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  19.2 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  19.72 
 
 		 443 aa  52.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  30.88 
 
 		 492 aa  51.2  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  19.38 
 
 		 329 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  20.53 
 
 		 398 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  22.93 
 
 		 942 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  19.85 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  20.88 
 
 		 322 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  19.69 
 
 		 323 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  21.43 
 
 		 387 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  20.88 
 
 		 325 aa  48.5  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  22.92 
 
 		 350 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  28.7 
 
 		 764 aa  47.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  18.75 
 
 		 342 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  20.6 
 
 		 326 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  19.35 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  19.46 
 
 		 1092 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  19.68 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  19.76 
 
 		 326 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  18.73 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  29.07 
 
 		 385 aa  43.5  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>