More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1692 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  100 
 
 		 321 aa  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.77 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.89 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.75 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.12 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.01 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.89 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.01 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.42 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.2 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.54 
 
 		 329 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.37 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.87 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.39 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.93 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.09 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.03 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  35.5 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  39.18 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  38.54 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.77 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  38.54 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  37.58 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  37.58 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  38.22 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  36.53 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.63 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.53 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.14 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  30.72 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.42 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  35.22 
 
 		 390 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  31.19 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  30.67 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.76 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  28.65 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.01 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  34.46 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.86 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.03 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.31 
 
 		 589 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  45.45 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  35.69 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.86 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.1 
 
 		 580 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  39.25 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.49 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  34.66 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.41 
 
 		 520 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.34 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  26.99 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.15 
 
 		 568 aa  132  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.67 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.16 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.24 
 
 		 548 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.78 
 
 		 559 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.16 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.75 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.95 
 
 		 561 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  26.88 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.67 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.27 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 388 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.29 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.81 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  32.53 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  35.38 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.27 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  35.38 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.47 
 
 		 663 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.56 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.56 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.59 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  35.11 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  34.07 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.3 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.16 
 
 		 695 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  31.85 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.01 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.95 
 
 		 562 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.12 
 
 		 562 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.12 
 
 		 562 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.12 
 
 		 562 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  29.11 
 
 		 652 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.12 
 
 		 562 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  33.07 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>