More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0101 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
358 aa  737    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.68 
 
 
335 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.01 
 
 
320 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.42 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.26 
 
 
329 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.82 
 
 
330 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.31 
 
 
326 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  33.97 
 
 
326 aa  198  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.54 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.34 
 
 
338 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.37 
 
 
327 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.89 
 
 
323 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.98 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.66 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.05 
 
 
320 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.64 
 
 
320 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  33.13 
 
 
320 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  34.49 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  34.49 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  34.49 
 
 
327 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.52 
 
 
332 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.15 
 
 
324 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  36.7 
 
 
327 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.59 
 
 
337 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.81 
 
 
335 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  30.38 
 
 
326 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  30.26 
 
 
339 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.81 
 
 
343 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.06 
 
 
383 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.21 
 
 
520 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.07 
 
 
339 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.96 
 
 
391 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
562 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  29.91 
 
 
284 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.9 
 
 
567 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 
322 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.77 
 
 
351 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.45 
 
 
559 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.87 
 
 
527 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.92 
 
 
517 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.84 
 
 
561 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.87 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.41 
 
 
589 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.15 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.19 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.1 
 
 
562 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.78 
 
 
562 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.78 
 
 
562 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.78 
 
 
562 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.78 
 
 
562 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.1 
 
 
562 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  28.49 
 
 
652 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.78 
 
 
562 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.91 
 
 
562 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.92 
 
 
688 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.61 
 
 
363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.91 
 
 
562 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.36 
 
 
737 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 
648 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.99 
 
 
650 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.21 
 
 
682 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.89 
 
 
562 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.36 
 
 
588 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.98 
 
 
579 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.6 
 
 
343 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.43 
 
 
547 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.41 
 
 
569 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.94 
 
 
540 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  41.95 
 
 
330 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  29.76 
 
 
650 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.45 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.59 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  31.25 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  27.2 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  37.36 
 
 
499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.71 
 
 
406 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.34 
 
 
462 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.17 
 
 
518 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.45 
 
 
663 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.8 
 
 
431 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.45 
 
 
622 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.2 
 
 
501 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.02 
 
 
698 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 
298 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.99 
 
 
562 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.9 
 
 
602 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 
551 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  31.19 
 
 
605 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.37 
 
 
678 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.49 
 
 
455 aa  137  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.2 
 
 
518 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 
320 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>