More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0505 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  77.52 
 
 
308 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.79 
 
 
337 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  30.74 
 
 
327 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  30.74 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 
327 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.77 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  32.14 
 
 
326 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.85 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  33.96 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 
326 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.89 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.29 
 
 
318 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.61 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.97 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.65 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.25 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  26.22 
 
 
390 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  24.6 
 
 
337 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.97 
 
 
322 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  26.22 
 
 
388 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.25 
 
 
324 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  27.18 
 
 
326 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.4 
 
 
335 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 
365 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.01 
 
 
344 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 
320 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.3 
 
 
329 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.22 
 
 
339 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  25.79 
 
 
389 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.24 
 
 
335 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  25.79 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.32 
 
 
735 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.71 
 
 
900 aa  96.3  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.12 
 
 
332 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.16 
 
 
330 aa  95.5  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.12 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  31 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  24.73 
 
 
389 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.73 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.61 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.23 
 
 
354 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 
499 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.91 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.55 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.5 
 
 
391 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  31.41 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.49 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.64 
 
 
807 aa  89.7  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
586 aa  89.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  30.39 
 
 
389 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.74 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.11 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.95 
 
 
755 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.52 
 
 
589 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  30.25 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  23.85 
 
 
625 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  22.88 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  25.27 
 
 
390 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.56 
 
 
359 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.93 
 
 
395 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.59 
 
 
391 aa  86.3  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  22.65 
 
 
388 aa  85.9  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.31 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.47 
 
 
610 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  34.62 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  28.15 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.29 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.97 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2759  DNA polymerase III subunit delta'  27.27 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2444  DNA polymerase III subunit delta'  27.27 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.12 
 
 
695 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.74 
 
 
546 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.55 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.32 
 
 
602 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.29 
 
 
518 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.23 
 
 
589 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.3 
 
 
580 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.97 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.1 
 
 
529 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  31.45 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  26.4 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.77 
 
 
588 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.12 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.67 
 
 
737 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.3 
 
 
559 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  28.26 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  29.28 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  26.22 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>