More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1351 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
365 aa  750    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.26 
 
 
343 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.52 
 
 
344 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.11 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.37 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.28 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.65 
 
 
324 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  37.23 
 
 
326 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.84 
 
 
320 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.39 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.93 
 
 
323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  31.48 
 
 
320 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.75 
 
 
320 aa  133  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.72 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.2 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.28 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.39 
 
 
322 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.16 
 
 
363 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.04 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.48 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.06 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.8 
 
 
485 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  35.84 
 
 
629 aa  126  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.5 
 
 
589 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.19 
 
 
321 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.91 
 
 
602 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.62 
 
 
338 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.09 
 
 
330 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  34.98 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  36.02 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.53 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.09 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.78 
 
 
737 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  32.59 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.23 
 
 
634 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.6 
 
 
520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.4 
 
 
567 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.56 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.56 
 
 
478 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.53 
 
 
621 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.13 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.05 
 
 
326 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.11 
 
 
501 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  31.75 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  35.6 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.24 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  31.62 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.23 
 
 
599 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.17 
 
 
724 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.98 
 
 
345 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.48 
 
 
447 aa  116  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.67 
 
 
351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.53 
 
 
575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  32.16 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
632 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  32.2 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.58 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  32.16 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.78 
 
 
580 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  30.18 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.14 
 
 
517 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
627 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 
389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.93 
 
 
664 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  30.7 
 
 
396 aa  113  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.84 
 
 
370 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.95 
 
 
550 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32.24 
 
 
394 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.38 
 
 
641 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.95 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.23 
 
 
644 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  39.62 
 
 
328 aa  112  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  28.09 
 
 
339 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.28 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.94 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.57 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  37.89 
 
 
900 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.79 
 
 
755 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.02 
 
 
602 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.07 
 
 
332 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.3 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.57 
 
 
401 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 
509 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.75 
 
 
427 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.32 
 
 
588 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.27 
 
 
343 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  36.15 
 
 
391 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.39 
 
 
395 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  35.65 
 
 
382 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.58 
 
 
610 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.84 
 
 
735 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.9 
 
 
682 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.53 
 
 
527 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  39.08 
 
 
284 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.05 
 
 
601 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.94 
 
 
509 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.26 
 
 
460 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.05 
 
 
732 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 
467 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>