More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0515 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
320 aa  644    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.55 
 
 
329 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.9 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.45 
 
 
330 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.52 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.82 
 
 
324 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.72 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.94 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.71 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.5 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.81 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.75 
 
 
358 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  31.48 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  29.34 
 
 
321 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.98 
 
 
338 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.1 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.5 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.61 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.16 
 
 
327 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  40.96 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.96 
 
 
599 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.57 
 
 
318 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.43 
 
 
332 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.4 
 
 
320 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  26.33 
 
 
328 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  31.71 
 
 
568 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.53 
 
 
644 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  32.82 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.02 
 
 
485 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.93 
 
 
565 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.93 
 
 
565 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.75 
 
 
755 aa  119  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.98 
 
 
641 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.97 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.38 
 
 
559 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 
328 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.9 
 
 
562 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.89 
 
 
634 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  32.49 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  28.45 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.82 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.63 
 
 
589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  32.49 
 
 
328 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  28.17 
 
 
328 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.43 
 
 
543 aa  116  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.46 
 
 
602 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.71 
 
 
312 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  29.37 
 
 
328 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  41.12 
 
 
595 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  25 
 
 
340 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  39.01 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  38.64 
 
 
602 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.37 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  37.5 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.13 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  30.09 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.59 
 
 
562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
522 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.07 
 
 
737 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.94 
 
 
621 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.33 
 
 
467 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.17 
 
 
562 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  28.74 
 
 
537 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.36 
 
 
724 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  37.29 
 
 
696 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.65 
 
 
664 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 
562 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.17 
 
 
562 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  40.13 
 
 
304 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.11 
 
 
517 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.38 
 
 
575 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  37.14 
 
 
629 aa  112  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  27.46 
 
 
328 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.17 
 
 
562 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.17 
 
 
562 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.17 
 
 
562 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  36.57 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  29.93 
 
 
390 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.01 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.12 
 
 
562 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  27.24 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.12 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.27 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  32.57 
 
 
529 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.61 
 
 
613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.2 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.13 
 
 
553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.64 
 
 
1137 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 
330 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  38.32 
 
 
631 aa  110  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  30.7 
 
 
327 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.4 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  25.75 
 
 
336 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  40.7 
 
 
579 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  34.87 
 
 
320 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  32.95 
 
 
324 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  39.88 
 
 
526 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  30.16 
 
 
389 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.34 
 
 
617 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>