More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0037 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
338 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.08 
 
 
335 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.34 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.11 
 
 
329 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.77 
 
 
320 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.02 
 
 
326 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 
330 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.4 
 
 
327 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.86 
 
 
321 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.91 
 
 
340 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  33.13 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.94 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.12 
 
 
320 aa  162  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.5 
 
 
335 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.69 
 
 
320 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.38 
 
 
320 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.51 
 
 
318 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.32 
 
 
324 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.78 
 
 
485 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.24 
 
 
344 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  40 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.3 
 
 
323 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.83 
 
 
351 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  32.98 
 
 
320 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.78 
 
 
641 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.42 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.52 
 
 
735 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.21 
 
 
343 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.08 
 
 
517 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  33.24 
 
 
339 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.69 
 
 
562 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.56 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  37.62 
 
 
807 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.04 
 
 
496 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.23 
 
 
467 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.44 
 
 
562 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.39 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.7 
 
 
614 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.12 
 
 
589 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  25.85 
 
 
568 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.39 
 
 
562 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 
632 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.39 
 
 
562 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.39 
 
 
562 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.39 
 
 
562 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.76 
 
 
501 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.39 
 
 
562 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.68 
 
 
602 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32 
 
 
562 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.11 
 
 
562 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.89 
 
 
447 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.88 
 
 
562 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.3 
 
 
510 aa  132  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.98 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.15 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.84 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.03 
 
 
551 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.46 
 
 
427 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  37.88 
 
 
579 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.82 
 
 
579 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.99 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.3 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.32 
 
 
520 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.18 
 
 
561 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.97 
 
 
565 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.28 
 
 
688 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.31 
 
 
543 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.97 
 
 
565 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.19 
 
 
737 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.07 
 
 
478 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  40.35 
 
 
499 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.81 
 
 
554 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  38.25 
 
 
900 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.07 
 
 
478 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.67 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.88 
 
 
582 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.37 
 
 
562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.14 
 
 
559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.14 
 
 
562 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  38.91 
 
 
298 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.22 
 
 
893 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  35.74 
 
 
572 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  37.31 
 
 
526 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.31 
 
 
569 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  28.94 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.17 
 
 
547 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.32 
 
 
529 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
826 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
825 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
825 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
825 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
825 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  33.44 
 
 
328 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
822 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.51 
 
 
821 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.02 
 
 
793 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  31.62 
 
 
548 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
363 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>