More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1995 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 335 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.31 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.26 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  37.04 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  34.46 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  35.28 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  42.25 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  34.15 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.35 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  34.04 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.74 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  37.6 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  37.9 
 
 		 295 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  35.67 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  37.21 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.86 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  36.51 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  39.9 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.04 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.5 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.9 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  33.03 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  47.4 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.23 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  31.98 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.15 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  32.27 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.57 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  35.9 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  32.35 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  34.63 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  42.47 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.24 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  33.24 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.57 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  36.84 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.05 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.05 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.17 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.05 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  30.6 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  33.03 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.9 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  32.66 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.22 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.77 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  34.96 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.76 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.23 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.77 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.04 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  33.04 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.32 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.88 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.88 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  42.66 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  34.1 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  35.9 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  43.38 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  33.81 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  40.84 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.01 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  32.03 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.02 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.61 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  36 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.3 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.26 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1914  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.78 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1589  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0776499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  28.79 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  34.34 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.7 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.74 
 
 		 599 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.74 
 
 		 644 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.69 
 
 		 641 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1315  DNA polymerase III subunit delta'  38.53 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000035358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.42 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  38.1 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2168  DNA polymerase III subunit delta'  38.1 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000087583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1277  DNA polymerase III subunit delta'  38.1 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.867386 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.37 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.52 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.99 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.89 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1985  DNA polymerase III subunit delta'  37.66 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000277224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>