More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2262 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 344 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  96.51 
 
 		 344 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  85.1 
 
 		 349 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  79.07 
 
 		 342 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  80.87 
 
 		 342 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  79.07 
 
 		 342 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  79.94 
 
 		 342 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  80.81 
 
 		 342 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  80.81 
 
 		 342 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  80.81 
 
 		 342 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  80 
 
 		 344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  52.74 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  53.35 
 
 		 336 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  55.52 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  53.35 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  53.35 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.72 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.52 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.52 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  34.68 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.47 
 
 		 357 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.72 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.69 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.42 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.71 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  35.65 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  38.81 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  35.69 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.76 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  33.52 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  33.61 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  41 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  33.99 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  32.68 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.69 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  33.61 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.81 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.46 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.9 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  28.73 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.63 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  27.43 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  32.96 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  32.51 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  32.51 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.92 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  33.86 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  27.92 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  34.07 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  39.25 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.82 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.83 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  37.37 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.38 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  32.62 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  34.58 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  34.29 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.17 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  34.29 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.69 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  34.6 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.05 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.99 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  30.11 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.27 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  34.03 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.79 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.4 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.57 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  27.08 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.25 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  35.44 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.71 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.23 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  29.62 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  34.72 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.21 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  32.49 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.43 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>