More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1006 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 351 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  74.49 
 
 		 331 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  74.64 
 
 		 332 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  73.12 
 
 		 333 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  71.55 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  66.09 
 
 		 336 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  66.76 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  54.79 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  53.33 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  49 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.73 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  35.38 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.55 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.71 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  35.38 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  33.24 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  31.74 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  33.05 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  32.32 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  31.74 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.53 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  28.21 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  31.46 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  32.3 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  31.55 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  28.91 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  33.61 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.67 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  37.95 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  35.34 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.45 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  34.33 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  34.33 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.04 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.6 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  37.95 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  31.56 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.2 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.3 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  37.32 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.76 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  36.84 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.58 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.04 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.04 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  29.05 
 
 		 389 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.96 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.97 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  32.66 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  30.47 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.71 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.48 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.41 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.41 
 
 		 363 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.01 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  29 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.7 
 
 		 690 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  29.05 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.4 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.92 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  27.65 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.2 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  28.99 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.36 
 
 		 650 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0572  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.46 
 
 		 692 aa  85.9  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000382536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.7 
 
 		 685 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  31.84 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.26 
 
 		 678 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.8 
 
 		 914 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.63 
 
 		 664 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  30.52 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  30.36 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.46 
 
 		 658 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  30.56 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.26 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.26 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  30.92 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.46 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.02 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2671  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.94 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.33 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  29.23 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.38 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.46 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>