More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1386 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 368 aa  764    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  40.28 
 
 		 344 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  38.83 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  39.44 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  38.61 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  39.61 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  37.29 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  35.13 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  35.85 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.51 
 
 		 339 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.74 
 
 		 334 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  36.26 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  35.98 
 
 		 336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  40.78 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  40.5 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  31.72 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.16 
 
 		 327 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  30.45 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.7 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.52 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  34.28 
 
 		 331 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  31.71 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  31.12 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  31.71 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  32.96 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  34.66 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.83 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.58 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  32.25 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  32.85 
 
 		 340 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.16 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  29.79 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  30.53 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  26.98 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  30.55 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  30.34 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  29.26 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  30.45 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  29.89 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  29.81 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  26.74 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  30.18 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.8 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  34.16 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  30 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  28.76 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.01 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  33.99 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  26.22 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.09 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  32.33 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  28.76 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.17 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  29.3 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  35.81 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  29.18 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  29.18 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.35 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  30.08 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.52 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.46 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.83 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3272  DNA polymerase III gamma/tau subunit  32.81 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.83 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.66 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.03 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.03 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.53 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.81 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.12 
 
 		 336 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  25.36 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  25.42 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  27.3 
 
 		 284 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.4 
 
 		 342 aa  96.3  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  28.45 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.15 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  34.04 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  35.38 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.31 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.66 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  26.42 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>