More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2078 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 358 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  80.95 
 
 		 360 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  80.95 
 
 		 360 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  41.21 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  47.52 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  45.62 
 
 		 341 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  43.49 
 
 		 343 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  45.21 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  45.32 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  36.94 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  34.39 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  37.24 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  36.47 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  36.47 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  36.17 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  34.33 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  36.97 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  35.58 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.22 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  35.91 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  37.25 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  35.42 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  35.42 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  33.92 
 
 		 364 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  36.7 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  34.12 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  33.8 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  33.53 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  33.62 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  36.65 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  34.97 
 
 		 346 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.41 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  36.89 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  38.06 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  32.26 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.75 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  35.22 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.22 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.72 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  41.92 
 
 		 319 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  44.59 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.98 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.86 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.75 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.45 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.92 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.28 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.69 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  31.09 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  36.02 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.04 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.72 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  28.69 
 
 		 631 aa  99.8  6e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.71 
 
 		 641 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  30.53 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.24 
 
 		 496 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.68 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.65 
 
 		 622 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  28.7 
 
 		 669 aa  98.2  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.36 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.56 
 
 		 737 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.89 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.57 
 
 		 584 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.63 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  31.22 
 
 		 582 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.44 
 
 		 589 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.17 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  33.33 
 
 		 605 aa  95.9  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.8 
 
 		 562 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.96 
 
 		 568 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  34.16 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  29.58 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  31.84 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  28.11 
 
 		 579 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.58 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.14 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.21 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.42 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.57 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1239  DNA polymerase III subunit delta'  29.6 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.72 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.06 
 
 		 562 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  35.58 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  29.09 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  35.58 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>