More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1453 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 349 aa  697    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  40.42 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.64 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  39.3 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  39.67 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  37.94 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  37.83 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  37.3 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  39.67 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  39.03 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  42.27 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  46.88 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  40.92 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  43.25 
 
 		 381 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  42.11 
 
 		 374 aa  185  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  37.35 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  38.23 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  37.61 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  37.03 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  42.64 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.36 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.05 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  37.33 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  32.48 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  41.39 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  35.29 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  35.76 
 
 		 364 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  32.55 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  32.55 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  33.93 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  45.23 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  47.85 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  36.26 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.94 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.89 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  35.84 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  34.51 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  35.9 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  35.96 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.49 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.25 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.97 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  32.27 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.49 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  34.36 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.53 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  33.09 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  31.87 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  35.06 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.34 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.12 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.55 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  33.46 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  31.98 
 
 		 529 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  33.58 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  35.92 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.39 
 
 		 723 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.63 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  35.96 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.05 
 
 		 572 aa  99.4  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.25 
 
 		 558 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.05 
 
 		 572 aa  99.4  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.91 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.13 
 
 		 694 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  28.52 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.57 
 
 		 553 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.66 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.69 
 
 		 736 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  32.74 
 
 		 537 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.47 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.92 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 698 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.43 
 
 		 743 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 658 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 658 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 658 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  34.35 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.87 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.86 
 
 		 559 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  34.35 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.3 
 
 		 612 aa  97.1  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.74 
 
 		 553 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.22 
 
 		 696 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.13 
 
 		 681 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.8 
 
 		 517 aa  96.7  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.15 
 
 		 751 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.31 
 
 		 685 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.83 
 
 		 681 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.81 
 
 		 689 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1055  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  31.31 
 
 		 631 aa  95.9  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0820336  normal  0.461674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.34 
 
 		 692 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>