More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0719 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 325 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  36.88 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  35.22 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  35.94 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  35.94 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.69 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.31 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  34.69 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  37.94 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  33.65 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.96 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  42.05 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  42.05 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.81 
 
 		 337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  38.35 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  29.5 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  39.9 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.36 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  29.49 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  33.75 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  27.41 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.52 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  37.81 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  35.68 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  37.62 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.28 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  37.31 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  30.99 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  29.71 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.42 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.15 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.56 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  34.67 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.49 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  33.03 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  36.98 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  36.57 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.8 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  37.63 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  38.83 
 
 		 349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.42 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1983  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.29 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258403  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  33.02 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  39.41 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.89 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.19 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  30.51 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.46 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.46 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.1 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  39.02 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  32.41 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  32.67 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  32.41 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  32.26 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.71 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  32 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.64 
 
 		 496 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.71 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  33.87 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.46 
 
 		 501 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  29.68 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.52 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  26.72 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.71 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.66 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.53 
 
 		 562 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.52 
 
 		 553 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.72 
 
 		 602 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.64 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.94 
 
 		 401 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.33 
 
 		 602 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.68 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  31.13 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  41.06 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.37 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.12 
 
 		 589 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  31.55 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.83 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.83 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 		 547 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.93 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.58 
 
 		 561 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.24 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.83 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.74 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.85 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.59 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>