More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0961 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 360 aa  730    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 360 aa  730    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  80.95 
 
 		 358 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  41.79 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  46.06 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  44.9 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  45.32 
 
 		 341 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  44.71 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  43.11 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 347 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  36.48 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  38.81 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  38.67 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  37.58 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  36.71 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  34.79 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.01 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  36.18 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  36.18 
 
 		 370 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  36.2 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  36.39 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  35.79 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  37.27 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  32.08 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  35.58 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  40.38 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.73 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  32.8 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  36.64 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  36.89 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  34.97 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  35.69 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  33.43 
 
 		 374 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  40.33 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.14 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  39 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.64 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  33.97 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.95 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  45.57 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.84 
 
 		 358 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.72 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  33.87 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.87 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.43 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.43 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.76 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.9 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.98 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  42 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  34.58 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.64 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.85 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  27.9 
 
 		 568 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.33 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  33.17 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.75 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  38.74 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.27 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  34.47 
 
 		 320 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  36.32 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.84 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.36 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 520 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  33.33 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  39.46 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  38.95 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  37.09 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.51 
 
 		 627 aa  96.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  33.48 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  33.48 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  32.62 
 
 		 605 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  32.29 
 
 		 595 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  37.2 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  38.79 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.35 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  33.49 
 
 		 307 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  39.05 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  27.23 
 
 		 339 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.11 
 
 		 565 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.11 
 
 		 565 aa  95.9  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  32.74 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.36 
 
 		 320 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  34.1 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  30.04 
 
 		 579 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.66 
 
 		 582 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.39 
 
 		 586 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.99 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.8 
 
 		 569 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  32.98 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.05 
 
 		 580 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  32.98 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.79 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>