More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6279 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 347 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  88.79 
 
 		 348 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  63.4 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  61.76 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  61.18 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  59.94 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  44.79 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  46.88 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  46.47 
 
 		 346 aa  228  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  44.64 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  44.74 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  42.74 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  44.51 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  39.89 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  38.12 
 
 		 346 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.94 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  45.43 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  45.73 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  38.73 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  45.73 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  41.92 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  42.14 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  39.13 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.23 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  36.99 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  37.97 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.66 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  42.8 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  36.87 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.03 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  35.93 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  45.28 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  37.92 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.91 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  45.56 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  37.99 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.71 
 
 		 914 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.61 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4752  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.5 
 
 		 605 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  37 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.44 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 		 529 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  32.84 
 
 		 625 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.95 
 
 		 613 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  32.79 
 
 		 605 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.09 
 
 		 627 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1127  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.38 
 
 		 733 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.97 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1035  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.62 
 
 		 731 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430627  normal  0.544075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.18 
 
 		 606 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 826 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 825 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 825 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 822 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 825 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.45 
 
 		 565 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.45 
 
 		 565 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 825 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 825 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.54 
 
 		 812 aa  96.3  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.27 
 
 		 611 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.06 
 
 		 622 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.79 
 
 		 624 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.89 
 
 		 793 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.18 
 
 		 821 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  32.26 
 
 		 648 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.83 
 
 		 793 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.49 
 
 		 584 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.6 
 
 		 728 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.77 
 
 		 623 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.94 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.93 
 
 		 791 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  29.23 
 
 		 537 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.21 
 
 		 338 aa  92.8  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.15 
 
 		 358 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.35 
 
 		 602 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.15 
 
 		 572 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.15 
 
 		 572 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.04 
 
 		 562 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.31 
 
 		 600 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  26.79 
 
 		 559 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.49 
 
 		 570 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.71 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.33 
 
 		 582 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.58 
 
 		 723 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  24.05 
 
 		 568 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.47 
 
 		 813 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.18 
 
 		 724 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.1 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.47 
 
 		 787 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.47 
 
 		 824 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.47 
 
 		 787 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.38 
 
 		 580 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.33 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>