More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2698 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 334 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  45.27 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  42.47 
 
 		 387 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  40.24 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  38.14 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  40.77 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  40.48 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  39.3 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  42.09 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  45.36 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  45.36 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  44.64 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  38.96 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  43.28 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  38.81 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  37.42 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  42.8 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.68 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  43.82 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  39.24 
 
 		 346 aa  172  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  38.42 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 360 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  37.65 
 
 		 341 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  35.45 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  35.45 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.93 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  40.83 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  40.26 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  35.58 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  33.13 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  34.76 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.84 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  45.04 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  36.19 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  39.9 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  39.8 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.62 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  37.56 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  40.4 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.52 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  37.09 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  43.37 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  37.13 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  42.77 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  40.37 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.44 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.79 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.42 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.31 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.48 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.02 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.95 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  36.82 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  35.05 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  36.82 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.73 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.22 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.31 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.77 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.46 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.27 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  38.92 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  34.94 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  31.47 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.37 
 
 		 589 aa  99.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  35.68 
 
 		 394 aa  99  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.7 
 
 		 517 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.33 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  34 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  39.02 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  30.15 
 
 		 529 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.35 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  27.97 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  37.93 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.02 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.7 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.8 
 
 		 320 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.09 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.54 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.79 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.94 
 
 		 558 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.7 
 
 		 553 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.52 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 389 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  32.24 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.17 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.2 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>