More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0821 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 347 aa  711    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  41.21 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  41.79 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  41.79 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  39.77 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  40.12 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  38.67 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  37.09 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  39.52 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  32.93 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  28.9 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  30.83 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.06 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  30.03 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  31.29 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  31.29 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  27.35 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  31.21 
 
 		 350 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  28.61 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  28.07 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  27.22 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  28.44 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  28.78 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  27.79 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  30.03 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  27.82 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  28.49 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  27.94 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.52 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.18 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  26.02 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  26.53 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  28.91 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  27.58 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  27.87 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  38.73 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  25.86 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.19 
 
 		 911 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.74 
 
 		 948 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  32.54 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  32.3 
 
 		 955 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.62 
 
 		 1147 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.62 
 
 		 1137 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  30.1 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.62 
 
 		 1115 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.63 
 
 		 1002 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  28.76 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.62 
 
 		 1113 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.26 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.62 
 
 		 1137 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.63 
 
 		 957 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.42 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.87 
 
 		 1071 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.3 
 
 		 939 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.34 
 
 		 921 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.87 
 
 		 1045 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  28.76 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  32.3 
 
 		 909 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  29.77 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.13 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.19 
 
 		 1040 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  30.42 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.66 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  29.88 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  31.86 
 
 		 696 aa  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.8 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.11 
 
 		 591 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  37.04 
 
 		 715 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.05 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.77 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  29.08 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.1 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.43 
 
 		 752 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.7 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.5 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.11 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.38 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 		 538 aa  99.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  31.88 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  30.7 
 
 		 577 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.8 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.38 
 
 		 737 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.7 
 
 		 736 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.42 
 
 		 755 aa  99.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.13 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 496 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.72 
 
 		 774 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  33.06 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.25 
 
 		 595 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.81 
 
 		 678 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.86 
 
 		 690 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.74 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  31.53 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.84 
 
 		 688 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.73 
 
 		 586 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>