More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4326 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 347 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  50.3 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  48.97 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  48.52 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  48.21 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  48.24 
 
 		 346 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  48.66 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  46.7 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  47.94 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  46.99 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  39.12 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  45.82 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  37.67 
 
 		 387 aa  215  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  43.82 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  39.82 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  38.58 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  40.8 
 
 		 343 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  38.44 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  38.8 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  38.58 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  44.78 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  39.5 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  44.61 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  44.4 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  37.24 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  37.04 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.83 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.14 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  40.98 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  36.71 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  36.71 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  38.51 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  34.86 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  30.23 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  37.33 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  43.2 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.42 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.88 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  36.97 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.2 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.48 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.04 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  38.53 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.47 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.09 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.1 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.81 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.1 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  42.07 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  32.82 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.65 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.98 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.7 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.73 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  37.39 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  36.07 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  39.73 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.54 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.09 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  36.97 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.83 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.86 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  37.3 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.88 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  32.46 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.27 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  37.33 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.02 
 
 		 586 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  27.93 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.02 
 
 		 584 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  37.33 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.03 
 
 		 562 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  29.3 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  39.46 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  28.57 
 
 		 579 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.18 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  35.19 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  35.19 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.32 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  37.37 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  35.98 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.6 
 
 		 517 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.68 
 
 		 320 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.91 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.36 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  27.09 
 
 		 312 aa  86.7  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  30.68 
 
 		 296 aa  86.3  8e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.88 
 
 		 318 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  35.33 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.18 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>