More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1582 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 354 aa  716    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  47.52 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  46.06 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  46.06 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  39.77 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  42.6 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  44.75 
 
 		 341 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  44.75 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  41.82 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  35.08 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  41.67 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  36.87 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  36.8 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  36.89 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  36.31 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  36.21 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  38.62 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  33.93 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  35.91 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  34.24 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  36.83 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.92 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  33.33 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  41.25 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  34.84 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  33.82 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  34.32 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  37.58 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  37.04 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.04 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  34.43 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  37.33 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.94 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.1 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.02 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.62 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.36 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  37.96 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  36.99 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  36.78 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  36 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.67 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.04 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.83 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  33.88 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  33.88 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.59 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.22 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.82 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  34.44 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  35.45 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  33.2 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.28 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.6 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.22 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.3 
 
 		 501 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.23 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.51 
 
 		 520 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  34.63 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  35.03 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  39.88 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 		 478 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  32.26 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  35.03 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.03 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.9 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  29.65 
 
 		 669 aa  98.2  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  28.02 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.69 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.45 
 
 		 641 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.53 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.42 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.82 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  28.91 
 
 		 629 aa  97.1  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  27.99 
 
 		 559 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.59 
 
 		 320 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.26 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.8 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.88 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.93 
 
 		 496 aa  95.9  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.57 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.21 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  47.57 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  27.85 
 
 		 562 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.06 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  32.71 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  38.06 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>