More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1276 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 374 aa  730    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  61.23 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  60.43 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  59.79 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  60.32 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  59.03 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  51.49 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  42.97 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  39.18 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  37.82 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  40.27 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  37.17 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  39.49 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  43.46 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  38 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  39.93 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  39.5 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  38.86 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  37.99 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  36.71 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  36.91 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.78 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  44.24 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.08 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  36.47 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  36.83 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  37.78 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  45.38 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  40.07 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.05 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.89 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  40.85 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  40.85 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  42.81 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  28.91 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.97 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.27 
 
 		 331 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.4 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.78 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  32.75 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.15 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  40.38 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  39.61 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.42 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  31.28 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  40.95 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.52 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  31.67 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  38.28 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.78 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.56 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  37.1 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  32 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  37.1 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_002978  WD0819  DNA polymerase III, subunit, putative  29.23 
 
 		 273 aa  94  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.746566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.56 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.77 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  37.76 
 
 		 328 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  36.2 
 
 		 328 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.63 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  35.53 
 
 		 306 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.13 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  38.73 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.94 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.15 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  41.77 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.87 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0985  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  28.23 
 
 		 382 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  41.94 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.05 
 
 		 320 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  35.78 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.55 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.64 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.5 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  35.78 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  37.57 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  28.33 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  30.67 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  37.57 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  31.31 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.87 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.91 
 
 		 427 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.92 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.07 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.49 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  33.48 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.2 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  29.44 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.15 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  34.47 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>