More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1189 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1189  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
366 aa  753    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.47 
 
 
326 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.8 
 
 
340 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.33 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.23 
 
 
774 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  28.86 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.31 
 
 
580 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  29.44 
 
 
389 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.06 
 
 
335 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.37 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.39 
 
 
320 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.85 
 
 
586 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28 
 
 
589 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  27.56 
 
 
529 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0572  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.05 
 
 
692 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000382536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.52 
 
 
363 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.87 
 
 
939 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.49 
 
 
667 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.41 
 
 
588 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.09 
 
 
329 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.75 
 
 
358 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.26 
 
 
331 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.07 
 
 
687 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.93 
 
 
363 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1085  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.81 
 
 
714 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.75 
 
 
658 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.37 
 
 
921 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.75 
 
 
658 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.75 
 
 
658 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.37 
 
 
327 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.18 
 
 
568 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0515  DNA polymerase subunits gamma and tau  33.33 
 
 
581 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.52 
 
 
589 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  27.51 
 
 
955 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  30.33 
 
 
909 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.49 
 
 
320 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.75 
 
 
650 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.51 
 
 
395 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.22 
 
 
320 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1919  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.66 
 
 
572 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  28.29 
 
 
337 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1591  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.66 
 
 
572 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.382177  normal  0.054959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.66 
 
 
605 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.17 
 
 
614 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.09 
 
 
351 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.51 
 
 
335 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.18 
 
 
647 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.72 
 
 
752 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.19 
 
 
391 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.25 
 
 
643 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.88 
 
 
642 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.93 
 
 
664 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.27 
 
 
736 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  27.92 
 
 
548 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.44 
 
 
690 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.34 
 
 
323 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.17 
 
 
637 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 
345 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1328  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, programmed frameshift  28.17 
 
 
547 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.35 
 
 
318 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.38 
 
 
948 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.87 
 
 
1137 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.73 
 
 
520 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 
326 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.29 
 
 
678 aa  99.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  25.06 
 
 
602 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.97 
 
 
685 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.91 
 
 
715 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  25.33 
 
 
365 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.97 
 
 
911 aa  99.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  27.93 
 
 
499 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.53 
 
 
957 aa  99.8  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.03 
 
 
562 aa  99.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.47 
 
 
1113 aa  99.4  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.87 
 
 
1147 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.86 
 
 
612 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.05 
 
 
587 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.91 
 
 
678 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.87 
 
 
1115 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  28.99 
 
 
320 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.3 
 
 
690 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.25 
 
 
723 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  32.7 
 
 
328 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.87 
 
 
1137 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.81 
 
 
914 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  25.3 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.91 
 
 
681 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 
591 aa  99  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.77 
 
 
1002 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.51 
 
 
642 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.82 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.51 
 
 
642 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>