More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2586 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
612 aa  1255    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.12 
 
 
560 aa  391  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.21 
 
 
561 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.81 
 
 
582 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.43 
 
 
582 aa  300  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.03 
 
 
551 aa  300  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.6 
 
 
567 aa  300  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.99 
 
 
602 aa  299  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.96 
 
 
579 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.75 
 
 
570 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.94 
 
 
579 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.43 
 
 
579 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.94 
 
 
582 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.11 
 
 
599 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.64 
 
 
559 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.41 
 
 
682 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.68 
 
 
570 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.58 
 
 
447 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.8 
 
 
550 aa  287  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  38.61 
 
 
396 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  43.54 
 
 
559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
534 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.58 
 
 
601 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.58 
 
 
601 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.13 
 
 
554 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.29 
 
 
569 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.7 
 
 
562 aa  281  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.11 
 
 
588 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.53 
 
 
562 aa  280  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.45 
 
 
863 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.48 
 
 
518 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.68 
 
 
518 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.79 
 
 
397 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  278  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.36 
 
 
732 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.8 
 
 
401 aa  276  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.9 
 
 
562 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.27 
 
 
562 aa  276  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.24 
 
 
562 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.14 
 
 
398 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  39.44 
 
 
796 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.91 
 
 
606 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.9 
 
 
562 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.44 
 
 
522 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.56 
 
 
644 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.24 
 
 
606 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.5 
 
 
547 aa  273  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.89 
 
 
586 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.45 
 
 
627 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.93 
 
 
632 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.51 
 
 
695 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.82 
 
 
575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.44 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  37.99 
 
 
396 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  38.95 
 
 
568 aa  270  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.37 
 
 
550 aa  270  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.48 
 
 
547 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.48 
 
 
547 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.54 
 
 
610 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.94 
 
 
565 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.88 
 
 
562 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.95 
 
 
589 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.94 
 
 
565 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  39.23 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.53 
 
 
634 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.61 
 
 
732 aa  267  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.59 
 
 
613 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.19 
 
 
642 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.19 
 
 
914 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.25 
 
 
553 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.19 
 
 
642 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.68 
 
 
643 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.19 
 
 
642 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.9 
 
 
478 aa  264  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 
589 aa  265  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.69 
 
 
582 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.9 
 
 
478 aa  264  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.19 
 
 
642 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.54 
 
 
872 aa  264  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.95 
 
 
587 aa  264  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.63 
 
 
427 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.1 
 
 
617 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.19 
 
 
642 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  34.81 
 
 
629 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.26 
 
 
643 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.26 
 
 
643 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.26 
 
 
643 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.22 
 
 
685 aa  263  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  44.26 
 
 
643 aa  262  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.26 
 
 
643 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.26 
 
 
643 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
637 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.77 
 
 
855 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.12 
 
 
527 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.26 
 
 
643 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>