More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0803 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  585  1e-166  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  77.7 
 
 
296 aa  461  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0819  DNA polymerase III, subunit, putative  36.52 
 
 
273 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.746566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  27.39 
 
 
374 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  26.53 
 
 
370 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  34.5 
 
 
373 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  26.53 
 
 
370 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  25.68 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  24.63 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  28.51 
 
 
387 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  31.72 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  34.44 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  22.97 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  25.82 
 
 
381 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.2 
 
 
349 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 
346 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  29.09 
 
 
348 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  23.25 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  32.28 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  29.44 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  31.84 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  32.35 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  31.69 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  24.13 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  31.22 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  24.19 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  31.46 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  29.26 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.71 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4190  DNA-directed DNA polymerase  23.45 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  30.99 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  31.68 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2680  DNA polymerase III subunit delta'  30.81 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4561  DNA-directed DNA polymerase  32.16 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  30.11 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.15 
 
 
337 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  29.67 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  28.35 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  28.33 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.26 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.66 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  32.68 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  32.67 
 
 
341 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.1 
 
 
562 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  26.19 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.73 
 
 
589 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  21.69 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  33.97 
 
 
602 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.39 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.17 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  24.5 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  24.5 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.17 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  31.17 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.39 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  31.17 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 
565 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 
478 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.77 
 
 
565 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  30.5 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.63 
 
 
568 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2704  DNA polymerase III subunit delta'  30.21 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.94 
 
 
602 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  30.06 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.43 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  30.56 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.21 
 
 
554 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.97 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.85 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0099  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.81 
 
 
603 aa  72  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.71 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  31.33 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  21.14 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  25 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.33 
 
 
570 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  29.71 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.25 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.77 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.48 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0611  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.24 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  30.43 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.68 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.76 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.03 
 
 
732 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.03 
 
 
582 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  28.37 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.39 
 
 
554 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.09 
 
 
582 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>