More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0819 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0819  DNA polymerase III, subunit, putative  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.746566  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  36.52 
 
 
295 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  36.61 
 
 
296 aa  169  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  27.8 
 
 
370 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  31.21 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  27.39 
 
 
370 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  29.87 
 
 
373 aa  95.5  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  30.98 
 
 
374 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  29.23 
 
 
374 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.45 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  27.08 
 
 
373 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2145  DNA polymerase III subunit delta'  34.81 
 
 
365 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  22.29 
 
 
323 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.16 
 
 
335 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  29.15 
 
 
347 aa  85.5  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.77 
 
 
329 aa  85.5  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1463  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.96 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  23.17 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  31.49 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  23.1 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4101  DNA polymerase III subunit delta'  27.47 
 
 
346 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.06 
 
 
427 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2009  DNA polymerase III subunit delta'  29.12 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  20.07 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  26.57 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  25.95 
 
 
696 aa  79.7  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  22.01 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.51 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.07 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  26.6 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  29.03 
 
 
582 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.57 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.81 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  24 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  30.9 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  31.69 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  30 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.67 
 
 
732 aa  76.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.45 
 
 
589 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.76 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.93 
 
 
582 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.93 
 
 
579 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 
602 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6279  DNA-directed DNA polymerase  26.78 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  29.83 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0377  hypothetical protein  26.62 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  27.57 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.31 
 
 
518 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  28.73 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.88 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32.09 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  31.72 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6922  DNA-directed DNA polymerase  27.72 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3115  DNA polymerase III subunit delta'  26.26 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0432076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.65 
 
 
948 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.09 
 
 
568 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.85 
 
 
579 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.58 
 
 
647 aa  72.8  0.000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  27.61 
 
 
529 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 
955 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  29.88 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.6 
 
 
921 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2759  DNA polymerase III subunit delta'  30.37 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2444  DNA polymerase III subunit delta'  30.37 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  29.08 
 
 
669 aa  72.8  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.04 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.35 
 
 
1113 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.12 
 
 
520 aa  72.4  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 
540 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.19 
 
 
632 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  31.72 
 
 
330 aa  72  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.61 
 
 
685 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  25.69 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1055  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  27.61 
 
 
631 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0820336  normal  0.461674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4706  DNA-directed DNA polymerase  28.4 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.586259  normal  0.0211469 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.05 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2716  DNA polymerase III subunit delta'  26.4 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  27.68 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1328  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, programmed frameshift  26.79 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.62 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  23.4 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1509  DNA-directed DNA polymerase  31.06 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.65 
 
 
911 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  28.93 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.93 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  28.28 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 
939 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  25.74 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.54 
 
 
1040 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.63 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.09 
 
 
690 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.19 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.25 
 
 
701 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_002620  TC0611  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.66 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.54 
 
 
957 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  28.22 
 
 
537 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>