More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0377 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0377  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0819  DNA polymerase III, subunit, putative  26.62 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.746566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  31.94 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  31.94 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  28.65 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  28.49 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.37 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0157  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  28.09 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0155  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  28.09 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  33.54 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0803  hypothetical protein  33.06 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.964068  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0275  ATPase  33.88 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.707781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.25 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  32.32 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 327 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.7 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.45 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  31.25 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  36.56 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.44 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  32.1 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  31.87 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  38.46 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  31.87 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  41.11 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1899  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  24.58 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  33.64 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  36.14 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.63 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.7 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  30.43 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  29.63 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  31.87 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  37.78 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  26.26 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.91 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  37.66 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  32.1 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1258  DNA-directed DNA polymerase  24.02 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.261442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0921  DNA polymerase III subunit delta'  27.97 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  40 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  32.1 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.05 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1239  DNA polymerase III subunit delta'  36.17 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  32.1 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1291  DNA polymerase III subunit delta'  31.18 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0826034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.08 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1351  hypothetical protein  43.59 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  30.86 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  32.47 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.78 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  34.58 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.24 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  30.86 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  30.86 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  43.59 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.32 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  31.15 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  32.29 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  34.58 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.38 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.06 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  31.53 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.73 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.21 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.05 
 
 		 323 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.05 
 
 		 320 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  32.48 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  32.48 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.43 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  37.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.15 
 
 		 318 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 340 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2156  DNA polymerase III subunit delta'  35.53 
 
 		 346 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 335 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  34.52 
 
 		 318 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 340 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.38 
 
 		 496 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  40.26 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.1 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>