More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0203 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0203  DNA polymerase III delta' subunit  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  37.58 
 
 
320 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  40.65 
 
 
320 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.71 
 
 
312 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  44.88 
 
 
312 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2290  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  38.16 
 
 
286 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.07 
 
 
324 aa  88.6  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.48 
 
 
322 aa  88.6  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.55 
 
 
343 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.29 
 
 
338 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.14 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1351  hypothetical protein  37.96 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  31.65 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.24 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.03 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  37.5 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.17 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.3 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.81 
 
 
320 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.98 
 
 
342 aa  82  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3018  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  28.18 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.73 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  35.51 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
320 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.7 
 
 
320 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.86 
 
 
332 aa  79  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  35.82 
 
 
339 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.62 
 
 
478 aa  78.6  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.3 
 
 
517 aa  78.6  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.62 
 
 
478 aa  78.6  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.69 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.77 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.38 
 
 
641 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.29 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.75 
 
 
330 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  33.33 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.47 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  33.82 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.17 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  39.47 
 
 
526 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.23 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.14 
 
 
737 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.47 
 
 
553 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  36.72 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.04 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.57 
 
 
529 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.89 
 
 
602 aa  75.5  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.04 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  29.01 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  43.33 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.04 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.21 
 
 
634 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.52 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.37 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  31.54 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.93 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.51 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  34.56 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.51 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.53 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  36.44 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0177  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  32.45 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  34.94 
 
 
669 aa  73.2  0.000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  36.44 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  30.18 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.39 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  30.18 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  30.18 
 
 
342 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  29.24 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.82 
 
 
318 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
318 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  35.9 
 
 
418 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.52 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.41 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.21 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  30.18 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.14 
 
 
485 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.35 
 
 
567 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.04 
 
 
614 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  35.05 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  34.43 
 
 
909 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0184  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  34.68 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.65 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  32.92 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.88 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.72 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  30.7 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.22 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.07 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.09 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.44 
 
 
667 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.52 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.05 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>