More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1355 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1351  hypothetical protein  96.68 
 
 		 301 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  38.93 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  40.65 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  38.04 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.04 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.77 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.6 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  37.91 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.42 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  37.42 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.31 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.65 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.65 
 
 		 335 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  28.76 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.06 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.3 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  27.99 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  27.99 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.4 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.05 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.13 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.33 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.33 
 
 		 320 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.6 
 
 		 343 aa  99  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  30.36 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.88 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  27.39 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  30.62 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  35.76 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  38.75 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.76 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  39.39 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  39.39 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.96 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  36.98 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  38.79 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  36.18 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  38.18 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  38.79 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  38.79 
 
 		 327 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  38.79 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  32.3 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.02 
 
 		 517 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  37.75 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  27.76 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 342 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.14 
 
 		 354 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  29.73 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 		 390 aa  92.8  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  36.43 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  30.39 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  27.18 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  34.38 
 
 		 382 aa  91.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  28.22 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.39 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  28.64 
 
 		 388 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.15 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  29.61 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  34.64 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  29.61 
 
 		 342 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.17 
 
 		 383 aa  90.1  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.24 
 
 		 485 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.8 
 
 		 351 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 389 aa  89.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.21 
 
 		 641 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  37.84 
 
 		 337 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.95 
 
 		 342 aa  89  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  34.59 
 
 		 382 aa  89.4  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  33.77 
 
 		 548 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.92 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  29.17 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  32.73 
 
 		 605 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.41 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  34.78 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.9 
 
 		 547 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  35.07 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.41 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  26.03 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.36 
 
 		 527 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  29.17 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.18 
 
 		 570 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.18 
 
 		 562 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.93 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  25 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  36.84 
 
 		 559 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.15 
 
 		 455 aa  85.5  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  33.57 
 
 		 320 aa  85.5  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.29 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>