More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2246 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  100 
 
 		 323 aa  668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  39.43 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  38.85 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  37.69 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.69 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.76 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  37.93 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  39.77 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  32.61 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.77 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  30.3 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  32.3 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  40.24 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  38.15 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  31.72 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  32.72 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  39.76 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  38.82 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.6 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  33.2 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  38.15 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  29.75 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  36.5 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  36.5 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  34.15 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.49 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.97 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.11 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  34.84 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  28.4 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  38.1 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  28.96 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  29.01 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.9 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.96 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  28.44 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  30.8 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.83 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.14 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  35.03 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.61 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.14 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.03 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.27 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.22 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  34.58 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  35.42 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.78 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  36.72 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.79 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.74 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.36 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  27.38 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  33.17 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.83 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  32.21 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  33.64 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.97 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.83 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.83 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.29 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.84 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  34.22 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.97 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  34.22 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  34.22 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  34.22 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.6 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.33 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.36 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.14 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.33 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1983  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.56 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258403  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.37 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1355  hypothetical protein  37.91 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1351  hypothetical protein  37.25 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.32 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  32.86 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  37.91 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.36 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.16 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.28 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  34.3 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.8 
 
 		 737 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.26 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  39.58 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.99 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  38.89 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  29.75 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>