More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0026 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
327 aa  673    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  91.44 
 
 
327 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  92.05 
 
 
327 aa  627  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  92.35 
 
 
327 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  92.35 
 
 
327 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  92.35 
 
 
327 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  92.05 
 
 
327 aa  627  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  92.35 
 
 
327 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  91.74 
 
 
327 aa  624  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  91.74 
 
 
327 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  91.44 
 
 
327 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  53.82 
 
 
337 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  52.41 
 
 
330 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  38.75 
 
 
326 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  33.64 
 
 
337 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  36 
 
 
358 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.07 
 
 
320 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.84 
 
 
335 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  36.79 
 
 
321 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.91 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.9 
 
 
320 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  31.29 
 
 
308 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  31.29 
 
 
308 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  33.2 
 
 
286 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.96 
 
 
326 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  31.61 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.83 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.11 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.19 
 
 
318 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.5 
 
 
331 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.87 
 
 
323 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.1 
 
 
478 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.1 
 
 
478 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.41 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  28.83 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.73 
 
 
339 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.63 
 
 
329 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.07 
 
 
427 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  39.04 
 
 
291 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  30.22 
 
 
499 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.92 
 
 
363 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.67 
 
 
540 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.07 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.92 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.69 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  29.48 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.68 
 
 
567 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.85 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  34.2 
 
 
287 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36 
 
 
588 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.94 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  40.61 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.44 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.18 
 
 
559 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.63 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36 
 
 
589 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  41.01 
 
 
284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.2 
 
 
517 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.74 
 
 
586 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.33 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.26 
 
 
522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.18 
 
 
579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.33 
 
 
582 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.96 
 
 
447 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.76 
 
 
527 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.85 
 
 
551 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.27 
 
 
391 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.67 
 
 
550 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.5 
 
 
589 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.67 
 
 
582 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.67 
 
 
649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.68 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.69 
 
 
688 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.42 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.12 
 
 
602 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 
328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  38.31 
 
 
328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.63 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  30 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.46 
 
 
569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  29.75 
 
 
328 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.17 
 
 
561 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.69 
 
 
582 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.34 
 
 
518 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.22 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.05 
 
 
579 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  35.11 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  37.91 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.35 
 
 
547 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.67 
 
 
467 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 
496 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  28.15 
 
 
326 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.18 
 
 
579 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  40.27 
 
 
327 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0374  DNA replication ATPase  36.26 
 
 
285 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.885704  hitchhiker  0.00000094265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.51 
 
 
562 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27 
 
 
562 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27 
 
 
562 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.32 
 
 
622 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>