More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1391 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 374 aa  768    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  48.94 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.91 
 
 		 366 aa  342  9e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  31.37 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  32.06 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  32.7 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.73 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  35.85 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  32.15 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  35.6 
 
 		 337 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  34.56 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.27 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.68 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  35.81 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  35.22 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  36.74 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  32 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  36.64 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  33.77 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  30.93 
 
 		 328 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  34.1 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.4 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  40.89 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.87 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  32.87 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.94 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  40.39 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  37.02 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  36.71 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  36.92 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  36.92 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.27 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  36.92 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  36.92 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  36.49 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.24 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  31.8 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  29.78 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.89 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  32.81 
 
 		 320 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  32.72 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  32.14 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  32.82 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.53 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.85 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  30.43 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  27.71 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  30.74 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.43 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.63 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  31.8 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.19 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  33.92 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.78 
 
 		 368 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  40.3 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  30.97 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  31.91 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  39.09 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  28.02 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  36.67 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  29.18 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.4 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  37.24 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.5 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  37.06 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.45 
 
 		 343 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  33.06 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  26.11 
 
 		 327 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  31.86 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  26.11 
 
 		 327 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 300 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.4 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  31.02 
 
 		 319 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  25.28 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  25.83 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  25.83 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  25 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  25.83 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.1 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.93 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  25.83 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.55 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.71 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  25.83 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  31.62 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.96 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  31.55 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  31.14 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  36.14 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>