More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2280 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  99.13 
 
 		 344 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 344 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  99.13 
 
 		 344 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  99.13 
 
 		 344 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  99.13 
 
 		 344 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  99.13 
 
 		 344 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  99.13 
 
 		 344 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  84.8 
 
 		 342 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  96.21 
 
 		 344 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  84.5 
 
 		 342 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  84.5 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  78.26 
 
 		 344 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  85.96 
 
 		 342 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  84.8 
 
 		 342 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  84.8 
 
 		 342 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  84.8 
 
 		 342 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  79.71 
 
 		 344 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  79.37 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  56.81 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  55.72 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  54.55 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  55.1 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  55.98 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.83 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.29 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.94 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  35.33 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.28 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.78 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.91 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.94 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  38.34 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  37.1 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  34.64 
 
 		 351 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  36.62 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  34.57 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  34.87 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  38.87 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  38.04 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.59 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  38.87 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.14 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.59 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  34.17 
 
 		 379 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.09 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  40.08 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  33.44 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.79 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  38.98 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  39.65 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.71 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.77 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  33.77 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  37.35 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  32.5 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  31.42 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  34.66 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  30.19 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  26.8 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  35.47 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  38.04 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.48 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 324 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  31.58 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  32.75 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  34.47 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.91 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.66 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.7 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  35.42 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.86 
 
 		 363 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.58 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  35.51 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  35.51 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.69 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  28.93 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  36.87 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.29 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.67 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.34 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  32.77 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.25 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.69 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  34.04 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  30 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.45 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>