More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1065 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  87.7 
 
 		 366 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 372 aa  762    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  48.91 
 
 		 374 aa  345  8e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  39.18 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.04 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  35.04 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  32.91 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  35.27 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  31.39 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  31.39 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  36.76 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  32.59 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  32.28 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  31.58 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  36.48 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.61 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.01 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.67 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  37.38 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  37.85 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  33.74 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  29.04 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  32.39 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  36.06 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  36.84 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  33.8 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  36.79 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.45 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  36.27 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.57 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  31.74 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  29.72 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.54 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.17 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  33.57 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.69 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  32.93 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  32.53 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  35.8 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.72 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.59 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  37.44 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  30.4 
 
 		 336 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  32.53 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  30 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  36.4 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.12 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.39 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  31.34 
 
 		 388 aa  92.8  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  32.56 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.89 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  29.55 
 
 		 337 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  38.02 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  29.07 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.96 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  33.17 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  28.4 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.36 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  26.83 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  32.84 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.54 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.54 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.93 
 
 		 320 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.71 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  30.88 
 
 		 390 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  33.48 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  28.37 
 
 		 327 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.9 
 
 		 312 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  31.94 
 
 		 320 aa  86.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  28.03 
 
 		 327 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.88 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  30.63 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  35.71 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  30 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.4 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  32.63 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.25 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  34.23 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.84 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>