More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2571 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  98.11 
 
 
318 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  98.11 
 
 
318 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  99.06 
 
 
318 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
318 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  87.11 
 
 
318 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  83.96 
 
 
318 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  83.65 
 
 
318 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  84.28 
 
 
318 aa  542  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  82.7 
 
 
318 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  59.93 
 
 
304 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  57.19 
 
 
304 aa  364  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1983  DNA polymerase III, delta prime subunit  58.69 
 
 
303 aa  360  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258403  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  56.39 
 
 
304 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.81 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.09 
 
 
321 aa  328  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2239  DNA polymerase III, delta prime subunit  54.38 
 
 
327 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.83 
 
 
331 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  41.24 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  41.24 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  42.38 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  30.09 
 
 
320 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.05 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  41.38 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  35.55 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.27 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.96 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  31.25 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  38.68 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  38.68 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.24 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  34.62 
 
 
328 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  38.68 
 
 
328 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  33.47 
 
 
328 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  38.86 
 
 
324 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 
300 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  38.68 
 
 
328 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 
361 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  39.43 
 
 
340 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.44 
 
 
351 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  35.44 
 
 
330 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.49 
 
 
328 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  38.86 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  36.54 
 
 
328 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.82 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.49 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  32.69 
 
 
334 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.41 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.58 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.72 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.22 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  33.7 
 
 
336 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.43 
 
 
336 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.89 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  35.83 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  33.19 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  35.68 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  42 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  36.05 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  29.12 
 
 
336 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.59 
 
 
335 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  32.6 
 
 
336 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 
325 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
334 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1985  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
334 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000277224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  35.58 
 
 
335 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  34.88 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  34.38 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1315  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000035358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1277  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
334 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.867386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2168  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
334 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000087583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 
343 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  30.96 
 
 
326 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0430  DNA polymerase III, delta' subunit  34.48 
 
 
332 aa  106  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  32.9 
 
 
327 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  32.9 
 
 
327 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 
332 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.81 
 
 
334 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000249721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01095  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0362811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2502  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0601626  unclonable  0.0000000133067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  35.17 
 
 
330 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2225  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000129004  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01103  hypothetical protein  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1478  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000175371  hitchhiker  0.00000000166006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1221  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1220  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.14 
 
 
342 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  32.26 
 
 
327 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2028  DNA polymerase III subunit delta'  34.25 
 
 
334 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000033373  hitchhiker  0.00000172568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  31.28 
 
 
327 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.26 
 
 
327 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  32.63 
 
 
342 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.74 
 
 
360 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  30.73 
 
 
327 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  32.26 
 
 
327 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.26 
 
 
327 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.34 
 
 
324 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  30.17 
 
 
327 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  30.73 
 
 
327 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>