More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1640 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 330 aa  669    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  98.76 
 
 		 323 aa  647    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  73.29 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  71.24 
 
 		 318 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  37.96 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.45 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  38.96 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.87 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.66 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  38 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  36.14 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  37.82 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  37.82 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  31.42 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.99 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  36.99 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  36.59 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  35 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  32.84 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.38 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  37.9 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  31.13 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.84 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  35.48 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  35.34 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  34.14 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  33.2 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  34.11 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.25 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  34.34 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  39.36 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.92 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.95 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  33.8 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0485  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.04 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.33 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.05 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  32.11 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.31 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.22 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.5 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  29.26 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2168  DNA polymerase III subunit delta'  33.8 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000087583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1277  DNA polymerase III subunit delta'  33.8 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.867386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.61 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.61 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1992  DNA polymerase III subunit delta'  36.45 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00150502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.89 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1315  DNA polymerase III subunit delta'  33.8 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000035358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1453  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.47 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675229  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.16 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  31.68 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  32.83 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  36.11 
 
 		 361 aa  99  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  28.89 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1985  DNA polymerase III subunit delta'  33.45 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000277224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  34.73 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.89 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  32.45 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.7 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.98 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.9 
 
 		 360 aa  96.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2698  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.69 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  37.2 
 
 		 360 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  37.2 
 
 		 360 aa  96.3  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.97 
 
 		 312 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  35.32 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.84 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0674  DNA polymerase III subunit delta'  33.18 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.593154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  34.8 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  35.52 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  36.7 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1804  DNA polymerase III subunit delta'  34.98 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  0.0173995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  30.94 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0556  DNA polymerase III subunit delta'  34.46 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.43 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.97 
 
 		 900 aa  93.2  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  30.5 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4326  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.45 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2328  DNA polymerase III subunit delta'  32.29 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.958116  normal  0.527061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.97 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  34.57 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.7 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  39.26 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.44 
 
 		 370 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.43 
 
 		 807 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  32 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  34.89 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  30.2 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.17 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  31.75 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.15 
 
 		 559 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  31.75 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.04 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  38.51 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  33.48 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>